壹、 工作職能
1.組織實施全國和全省相關急性法定傳染病（鼠疫、霍亂、傳染病性非典型肺炎、人感染高致病性禽流感、流行性出血熱、狂犬病、登革熱、炭疽、細菌性痢疾、傷寒和副傷寒、猩紅熱、布魯氏菌病、鉤端螺旋體病、流行性感冒、急性出血性結膜炎、流行性和地方性斑疹傷寒、其他感染性腹瀉病）預防控制規劃、計劃和方案中的相關工作。
2.組織實施開展相關重點急性傳染病監測。收集、分析、報告和反饋相關重點急性傳染病監測信息，預測相關重點急性傳染病的發生、流行趨勢，提出預防控制對策。對重點傳染病的發生、流行以及影響其發生、流行的因素，進行監測。
3.參與相關急性傳染病重大疫情或突發公***衛生事件的流行病學調查、現場處理及其效果評價。
4.開展相關急性傳染病的健康教育、咨詢，普及傳染病防治知識。
5．指導、培訓下級疾病預防控制機構及其工作人員開展相關急性傳染病監測和暴發疫情的調查處理工作。
6．開展相關急性傳染病預防控制應用性研究和衛生評價，提供技術咨詢。
7．完成上級和中心交付的任務。
二、內部設置
1．傳染病防治壹組：負責腸道傳染病（霍亂，細菌性痢疾，傷寒和副傷寒、除霍亂、細菌性痢疾、傷寒和副傷寒以外的感染性腹瀉等）、新發傳染病（瘋牛病）等相關傳染病的監測、暴發調查、預防與控制。流研所日常事務管理。
2．傳染病防治二組：負責人畜***患、蟲媒傳染病（鼠疫，流行性出血熱，登革熱，炭疽，猩紅熱，布魯氏菌病，鉤端螺旋體病，流行性和地方性斑疹傷寒等）等相關傳染病的預防與控制。
3．傳染病防治三組：負責呼吸道傳染病（流感、禽流感、SARS等），不明原因肺炎監測、預防控制、暴發調查。負責狂犬病、急性出血性結膜炎監測與防控。 壹、工作職能
1.協助省防治艾滋病工作委員會、省衛生廳制定、組織實施艾滋病預防控制計劃及相應的控制策略和措施；
2.負責對全省艾滋病預防控制工作的技術指導、人員培訓；
3.負責對艾滋病重大疫情的調查處理；開展艾滋病監測及相關防治技術、方法、標準、規範等的制定與研究；
4.負責對艾滋病預防控制信息的收集、統計、分析、綜合評價、疫情報告；
5.負責全省艾滋病抗病毒治療藥品的供應與管理工作；
6.負責全省艾滋病病毒職業暴露預防與應急處理工作；
7.開展艾滋病防制科研、宣傳教育和行為幹預工作；
8.負責國家\省內HIV哨點檢測、全省血液制品感染因子的監測、全國HIV初篩試劑質量評估及耐藥性監測；
9.負責對全省HIV抗體檢測實驗室進行技術指導、質量控制、檢測技術人員培訓；
10.開展相關艾滋病檢測技術、方法、標準、規範等的制定與診斷試劑的研究、承擔相關藥物效果的評價及有關的科研工作；
11.開展艾滋病病毒載量測定、CD4檢測等相關檢測；
12.完成省防治艾滋病工作委員會辦公室、省衛生廳及中心臨時交付的其他工作；
二、設置
內設：流行病組 實驗室組 壹、工作職能
1.實施寄生蟲病的控制、監測計劃，制訂相應的控制對策和措施；
2.負責寄生蟲病信息的收集、統計分析、綜合評價和疫情報告；
3.指導全省基層開展寄生蟲病的防治和技術培訓；
4.開展寄生蟲病防治的科研和宣教工作；
5.負責寄生蟲病防治藥物診斷試劑的研發與推廣。
二、設置
內設：綜合室、防治室、實驗室。 壹、工作職能：
1.協助衛生行政部門制定和組織實施免疫規劃工作；
2.負責免疫規劃針對傳染病疫情監測和處理；
3.負責第壹類疫苗的分發、免疫效果監測與評價；
4.負責疑似預防接種異常反應監測和處理；
5.組織開展免疫防病知識健康宣傳教育、業務培訓和科研工作；
6.組織承擔廣東省免疫規劃專家咨詢委員會、廣東省預防接種異常反應診斷小組和廣東省AFP病例分類專家診斷小組的日常工作。 二、設置：
內設流行病壹組、流行病二組、綜合組 壹、工作職能
1.負責對滅鼠、殺蟲用品進行衛生質量監測；
2.調查、掌握我省主要病媒生物的種群分布、生態習性和季節消長情況，為病媒生物預測提供技術支撐；
3.協助愛衛辦對全省城鎮除四害工作進行技術指導和考核鑒定；
4.負責消殺藥品的研發與推廣應用；
5.協助傳染病爆發疫情等突發事件的調查處理；
6.組織開展醫療機構和托幼機構消毒質量監測；
7.開展醫院感染控制重要環節的調查，及醫院感染暴發流行的調查處理；
8.協助全省鼠疫流行病調查工作並開展鼠類體外蟲媒調查工作；
9.承擔地震、洪水和冰凍等重大自然災害中衛生消毒和病媒控制的技術指導；
10.衛生昆蟲和鼠類飼養，及相關藥物抗性的監測和測試實驗。
二、內部設置
消毒組、媒介控制組 壹、工作職能
1.制定和實施全省重大慢性非傳染性疾病與傷害預防控制工作的計劃，並進行專題調查 及相關科學研究，同時指導建立其監測系統、組織管理國內外合作項目及相關的交流活動；
2.組織實施全省性居民營養與健康狀況專題調查；
3.負責市級慢性非傳染性疾病與傷害防治機構人員的業務指導與培訓；
4.開展學生常見與多發病監測及與學生健康相關的科研工作；
5.完成上級機構下達的有關工作。 壹、工作職能
1. 實施有關關食品衛生、環境衛生相應的工作任務；
2. 負責制訂衛生相關產品監測計劃和衛生產品的檢驗受理、樣品保管、衛生學評價、檢驗報告發送；
3.參與對突發公***事件、食物中毒、違法案件的現場衛生學調查和采樣；
4.負責有關部門的專項抽檢任務；
5.開展食品衛生、環境衛生的國家標準的制（修）訂、健康相關產品的人體實驗及相關的科研；
6.指導儀器生產企業實施GMP和HACCP管理體系；
7.開展對基層單位食品衛生、環境衛生學科相關技術的指導和培訓；
8.實施碘缺乏病；地方性氟中毒的控制、監測計劃。
二、設置
內設：綜合組、環境衛生組、食品組、樣品受理組、報告發送組、地病組