本系曾獲多項重大科技成果獎，並獲“八五”和“九五”期間國家科技研究優秀成果獎。近年來獲得國家商業科技進步獎8項，上海市科技進步獎2項，申請國家發明專利4項。R&D部門致力於食品安全領域的系列研究，取得了顯著進展，對上海的食品安全工作起到了積極作用。
在開展食品科技研究的同時，R&D部門積極開展面向食品行業中小企業的技術服務，完成了400多個服務項目。目前正在搭建“上海市食品行業中小企業服務平臺”，涵蓋新產品開發、產品改進、工藝設計、設備造型定制、生產現場指導、質量衛生指導培訓、協助制定技術規範和產品標準、建立生產質量控制體系等內容。服務平臺建成後，每年可為50家中小企業提供各類有效的技術服務。
R&D部還積極投入我國中西部地區的開發，先後承擔了市科委西部大開發、市農委招標項目三個項目，為30多家社會企業提供了各類技術服務，是對社會的良好補充，有力地促進了上海食品工業的整體技術水平。檢測中心是中國合格評定國家認可委員會(CNAL)認可的檢驗機構。通過了國家質量技術監督局和上海市質量技術監督局的計量認證考試和歷次復查，並被上海市質量技術監督局授權為上海市副食品質量監督檢驗站，是能出具第三方公正報告的中介機構。中心現有實驗室14個，建築面積1000 M2，擁有氣-質聯用儀、高效液相色譜儀、氣相色譜儀、原子吸收分光光度計、熒光分光光度計、紫外-可見分光光度計等儀器30多臺套。經政府主管部門授權，可對肉類、禽類、蔬菜、豆制品、水產品、糧油、冷飲、飲料、醬菜等26種產品質量進行監督檢驗，包括微生物檢驗、常規理化檢驗、農藥殘留檢測等200多項檢驗項目。，年檢驗量約10000個樣本，多次被評為中國商業聯合會檢驗系統先進集體。
檢測中心完成了本市食品質量監督監測、國家中央儲備肉公共檢測、企業委托的產品質量檢測、本市綠色食品相關認證檢測等多項任務。同時，檢測中心還接受企業的委托，承擔對其產品安全質量的長期監測，如肯德基170多家門店，家樂福、麥德龍、農工商、迪亞、上海高校後勤服務中心等大型連鎖超市。華淩科技發展有限公司是研究院對外經營的窗口，專註於產品營銷和技術營銷。營銷產品包括自主研發的高溫高壓多級殺菌裝置、自動殺菌洗手裝置、食品周轉箱清洗裝置、冷凍食品品質改良劑、糕點品質改良劑等產品，以及軟包裝竹筍、食品除氧保鮮劑、飲用水等品牌產品。還代理銷售國內外食品企業的食品原料、添加劑和設備，直接為中小食品企業提供便利。