為保護人民健康，保障工農業生產、基本建設、交通運輸和消費者的安全，世界上各主權國家相繼制定了食品、藥品、化妝品和醫療器械衛生法規，涉及安全的各種機電電子設備、交通運輸工具和消費品安全法規，動植物及其產品檢疫法規，傳染病檢疫法規等衛生檢疫法規，規定有關產品進口、攜帶或郵寄入境。他們必須持有出口國官方檢驗檢疫機構證明其符合相關安全、衛生、檢疫法律和標準的證書，甚至規定生產加工企業的質量安全衛生保障體系必須經過出口國或進出口國官方註冊認可，使用法律法規要求的產品標簽和合格標誌，其產品才能獲得市場準入資格。許多法規和標準形成了國際法規和標準。
出入境檢驗檢疫是合理利用國際通行的非關稅技術壁壘，保證我國對外貿易順利持續發展的需要。
2.進出口商品官方檢驗檢疫和監督認證是突破外貿技術壁壘，建立國家技術保護壁壘的重要手段。
為了保護人民健康，保障工農業生產、基本建設、交通運輸和消費者的安全，世界上各主權國家相繼制定了食品、藥品、化妝品和醫療器械衛生法規，各種機電電子設備、與安全有關的運輸工具和消費品安全法規，動植物及其產品檢疫法規，傳染病檢疫衛生檢疫法規， 規定產品必須得到出口國官方檢驗檢疫機構的認證，符合相關的安全、衛生和檢疫法規和標準。 甚至規定生產加工企業的質量安全衛生保證體系必須經出口國或進口國官方註冊認可，並使用法律法規要求的產品標簽和合格標誌，其產品才能獲得市場準入資格。許多法律法規已經形成了國際法規，如出口危險貨物的包裝，必須符合聯合國海運協會《危險貨物運輸規則》的規定。
中國檢驗檢疫機構對出口產品或中國生產加工企業的官方檢驗檢疫和監督認證，是突破外貿技術壁壘，獲得國外市場準入資格，使中國產品在國外順利通關的保障。
中國檢驗檢疫機構加強對進口產品的檢驗檢疫和對國外相關生產企業的註冊登記和監督管理，符合國外通行的技術性貿易壁壘，以合理的技術規範和措施保護國內產業和國民經濟的順利發展，保護消費者的安全、健康和合法權益，為維護國家的根本利益建立可靠的屏障。
3.加強對重要出口商品的質量強制檢驗，是為了促進我國產品質量的提高和國際市場競爭力的提高，從而擴大出口。
在日益激烈的世界貿易競爭中，如果出口商品質量差，必然影響對外交易，賣不出去或賣不上好價錢。即使勉強推廣，也會造成不良影響，導致退貨或索賠，甚至失去國外市場，給國家造成經濟損失和政治不良反應。尤其是目前世界上大多數國家都提倡限制進口，消費者對商品質量的要求越來越高。為了維護國家經濟利益和對外聲譽，有必要對重要的出口商品實行強制檢驗，以保證其質量、規格、包裝、數量、重量符合對外貿易合同和有關標準的要求。
加強進口商品檢驗是為了保證國內生產安全和人民身體健康，維護國家對外貿易的合法權益。
隨著對外貿易的發展，進口商品逐漸增多。總的來說，進口商品的質量還是比較好的，但是問題還是很多。經常發現進口貨以次充好，老的頂級，少的有風險，摻假的以假亂真。如果不認真檢查，不僅會遭受經濟損失，還會嚴重影響生產建設和人民健康。因此，必須按照合同和有關標準嚴格檢驗進口貨物的質量、規格、包裝、數量和重量，以確保進口貨物的質量。
5.在國際貿易中，外貿、運輸、保險當事人往往要求官方或權威的非當事人提供進出口商品的質量、重量、包裝、裝運技術條件的檢驗證書，作為出口商品交貨、結算、開票、征稅和進口商品質量、缺陷索賠處理的有效證據。中國檢驗檢疫機構對進出口商品進行檢驗，提供各種檢驗鑒定證書，是外貿相關方履行貿易、運輸、保險合同和處理索賠糾紛的公正、權威的必要憑證。
出入境動植物檢疫對於保護農、林、牧、漁業生產安全，促進農畜產品對外貿易，保護人體健康具有重要意義。
保護農林牧漁業生產安全免受重大國際疫情災害，是中國出入境檢驗檢疫機構承擔的重要使命。
對來自動植物疫區的動植物、動植物產品和其他檢疫物以及集裝箱、包裝物、運輸工具(包括集裝箱)實施強制檢疫。這將防止動物傳染病、寄生蟲和植物危險性性病、蟲、雜草等有害生物和其他危險性疫情等檢疫對象進出境，保護農林牧漁業生產安全和人民身體健康，履行我國與外國簽訂的檢疫協議義務，突破進口國在動植物檢疫方面設置的貿易技術壁壘， 從而使我國農林牧漁產品順利進入國內，促進農畜產品對外貿易的發展。
(5)國境衛生檢疫是防止檢疫傳染病傳播，保護人體健康的壹道非常重要的屏障。
中國邊境線長，口岸多，對外開放的海陸空口岸超過100個，是世界上開放口岸最多的國家之壹。近年來，各種檢疫傳染病和監測傳染病仍在壹些國家和地區發生和蔓延，出現了壹批新的傳染病，特別是鼠疫、霍亂、黃熱病、艾滋病等壹些烈性傳染病及其傳播媒介。隨著國際貿易、旅遊和交通運輸的發展，出入境人數迅速增加，隨時有被傳入的危險，對各國人民的健康構成威脅。因此，對出入境人員、車輛、交通運輸設備以及行李、貨物、郵包等可能傳播傳染病的物品實施強制檢疫，對於防止檢疫性傳染病傳入或者傳播，保護人體健康具有重要作用。
綜上所述，出入境檢驗檢疫在保障國民經濟發展、消除國際貿易技術壁壘、保護消費者利益、實施我國對外交往中發揮著非常重要的作用。