經營第二類醫療器械需要到市局備案，由市局出具備案證明。
經營第三類醫療器械需經市局許可，核發許可證。
從2014年10月1日起，《醫療器械經營許可證》必須網上申報，經現場考核合格後方可辦理。
從市食品藥品監督管理局網站首頁 "網上辦事 "欄目的 "醫療器械生產經營許可備案信息系統 "點擊進入。
進入登陸頁面後，有專門的操作手冊和教程視頻下載界面，申請企業可以下載使用。
申請許可事項備案，除應在系統中完成網上申報外，還應將紙質材料報送相應審批備案部門後方可辦理。
註：1.營業執照非企業，是個體工商戶的，不允許申請醫療器械經營許可證。
（個體）工商戶營業執照可以升級到工商局辦理。具體步驟是：先到工商局的工商所管片登記、填表，然後拿相關材料到政務大廳辦理營業執照的升級，升級為企業後，再辦理組織機構代碼證，然後到網上申報。
2、《醫療器械備案申請表》需提交電子材料，其中加*為必填項。
電子材料上傳僅支持上傳圖片和pdf格式材料。
1.*營業執照、組織機構代碼證復印件
2.*經營範圍、經營方式說明
5.*經營場所、庫房地址地理位置圖、平面圖、產權證明文件或租賃協議（附產權證明文件）復印件
6.經營設施、設備目錄
7.經營質量管理制度、工作程序等文件
8.計算機信息管理系統基本情況及功能說明
9.經營者授權證明
10.經營者授權證明
11.經營者授權證明
12.經營者授權證明
13.經營者授權證明
14.經營者授權證明
15.*簽字蓋章的申請表掃描件
3、許可與備案的區別在於許可必須有第 8 項：計算機信息管理系統基本信息和功能描述、計算機管理系統。