物理消毒滅菌法是醫學實踐中常用的方法，通常包括熱力、紫外線、輻射、超聲波和濾過除菌等。
(壹)熱力滅菌法
熱力能破壞微生物的蛋白質和核酸，使蛋白質變性凝固，核酸解鏈崩裂，從而導致其死亡。
1.幹熱滅菌法 常用焚燒、燒灼和幹烤等方法。
(1)焚燒與燒灼 焚燒僅用於廢棄的被病原微生物汙染的物品、垃圾、人及動物屍體等。燒灼用於微生物實驗室的接種環、金屬器械、試管口、瓶口等的滅菌。
(2)幹烤 使用幹烤箱滅菌，壹般需加熱至160℃～170℃經2h，可達到滅菌的目的。適用於玻璃器皿、瓷器、金屬物品等的滅菌。
2.濕熱消毒滅菌法
(1)巴氏消毒法 法國學者巴斯德創用而得名。主要以較低溫度殺滅病原菌或特定微生物，而使物品中不耐熱成分不被破壞。此法有兩種：壹種方法是加熱61.1℃～62.8℃、30min；另壹種方法是加熱71.7℃、15～30s。現在人們多用後種方法對牛奶進行消毒。
(2)煮沸法 煮沸100℃、5～10min，可殺死細菌繁殖體。芽胞則需要煮沸1～2h。常用於註射器、食具與飲水的消毒。
(3)流通蒸氣法 用阿諾(Arnold)蒸鍋或普通蒸籠，加熱100℃、15～30min，可殺滅細菌的繁殖體。若將消毒後的物品放入37℃孵箱培養，使芽胞發育成繁殖體，次日再蒸壹次，如此連續三次以上，可達到滅菌效果，這種方法稱為間歇滅菌法。常用於不耐高溫的物品，如糖類、血清和雞蛋培養基等的滅菌。
(4)高壓蒸氣滅菌法 是壹種迅速而有效的滅菌方法。使用高壓蒸氣滅菌器，利用加熱產生蒸氣，隨著蒸氣壓力不斷增加，溫度隨之升高，通常壓力在103.4kPa(相當舊制的15磅/吋 2 或1.05kg/cm 2 )時，器內溫度可達121.3℃，維持15～30min，可殺滅包括芽胞在內的所有微生物。此法常用於壹般培養基、生理鹽水、手術器械及敷料等耐濕和耐高溫物品的滅菌。
(二)紫外線與電離輻射
1.日光與紫外線 日光消毒是最簡單、經濟的方法，將病人的被褥、衣服、書報等在日光下曝曬數小時，可殺死表面的大部分微生物。日光中殺菌的成份主要是紫外線。紫外線200～300nm時，具有殺菌作用，其中以265～266nm波長的紫外線殺菌力最強。紫外線的殺菌原理，主要是細菌DNA吸收紫外線後，壹條鏈上相鄰的兩個嘧啶通過***價鍵結合形成二聚體，從而幹擾了DNA的正常堿基配對，導致細菌死亡或變異。
紫紅外線能透過石英，但不能穿過壹般玻璃或薄紙，因此，紫外線只適用於物體表面及空氣的消毒。例如手術室、嬰兒室、傳染病房、無菌制劑室、微生物接種室的空氣消毒。
2.電離輻射 X射線、γ射線和陰極射線等電離輻射，有較高的能量與穿透力，因而可產生較強的致死效應。其機制在於產生遊離基，破壞DNA。此法常用於大量壹次性醫用塑料制品的消毒；亦可用於中藥成藥和食品的消毒，而不破壞其化學成分和營養成分。
(三)超聲波
超聲波是不被人耳感受的高於 20千周/s的聲波。其殺菌機制主要是它通過水時發生空化作用，而破壞了細菌細胞質的膠體狀體，使其胞膜、胞質分離，胞壁及胞膜破碎致細菌繁殖體死亡。此法主要用於粉碎細胞，以提取細胞組分或制備抗原等。
(四)微波
是壹種波長為 1mm到1m左右的電磁波，稱微波。它能穿透玻璃、塑料薄膜與陶瓷等物質，但不能穿透金屬表面。目前用於消毒的微波有2,450MHz與915MHz兩種，常用於檢驗室用品、非金屬器械、無菌病室的食品用具及其它用品的消毒。
(五)濾過除菌
濾過除菌是用濾菌器阻留過濾液體和氣體的細菌，以達到無菌的目的。濾菌器含有微細小孔，只允許液體或氣體通過，而大於孔徑的細菌等顆粒不能通過。常用濾菌器有蔡氏濾器、玻璃濾器、薄膜濾器及高效顆粒空氣濾器四種。主要用於不耐熱的血清、抗毒素、生物藥品以及空氣等的除菌。
二、化學消毒法
許多化學藥物都有抑制或殺滅微生物作用，按作用不同分為化學消毒劑和化學治療劑兩類，用於消毒、防腐和治療疾病。
(壹)常用消毒劑的種類和應用
具有殺死微生物的化學藥物稱消毒劑。消毒劑對人體有毒性作用，只能外用，不能內服。主要用於皮膚粘膜的傷口、器械、排泄物和周圍環境的消毒。消毒劑在低濃度時也可作防腐用，但防腐劑的關鍵是應要對人體無毒性作用。消毒劑種類濃度與用途見表 13-1。
表 13-1 常用消毒劑的種類濃度與用途
類別
名稱
濃度
用途
重金屬鹽類
紅汞
2%
皮膚粘膜的小創傷消毒
升汞
0.05%～0.1%
非金屬器皿浸泡消毒
硝酸銀
1%
新生兒滴眼防淋球菌感染
氧化劑
高錳酸鉀
0.1%
皮膚粘膜消毒
過氧化氫
3%
皮膚粘膜創口消毒
過氧乙酸
0.2%～0.5%
塑料、玻璃器材消毒
碘酒
2.0%～2.5%
皮膚消毒
氯
0.2ppm～0.5ppm
飲水及遊泳池消毒
漂白粉
10%～20%
地面、廁所與排泄物消毒
醇類
乙醇
70%～75%
皮膚、體溫表消毒
酚類
石碳酸
3%～5%
地面、器具表面的消毒
來蘇
2%
皮膚消毒
醛類
甲醛
10%
物品表面、空氣消毒
戊二醛
2%
精密儀器、內窺鏡消毒
表面活性劑
新潔爾滅
0.05%～0.1%
皮膚粘膜、器械消毒
杜滅芬
0.05%～0.1%
皮膚創傷沖洗、金屬器械、塑料、橡皮類消毒
染料
龍膽紫
2%～4%
淺表創傷消毒
酸堿類
醋酸
500mml/100m 3
加等量水蒸發
空氣消毒
食醋
2%溶液，
3～5ml/m 3
熏蒸消毒空氣
生石灰
加水 1：4
或 1：8
配成糊狀
排泄物及地面消毒