部分地區已將部分基因檢測項目納入醫保支付範圍。腫瘤基因檢測在報銷範圍內，可以報銷。癌癥基因檢測、重離子治療等項目因醫保基金承受能力有限，難以納入。國家醫保局指出，國家層面在界定基本醫保不支付和支付部分費用的醫療服務範圍時采用了排除法，但基因檢測相關的醫療服務未被排除。所以越來越多的人說，高費用的腫瘤基因檢測項目應該納入醫保。北京已將癌癥藥物基因檢測項目納入北京醫保報銷範圍，報銷比例高達90%。包括腫瘤組織DNA測序，項目費用3800元，屬於北京醫保乙類..
目前很多肺癌靶向藥物已經納入醫保。但是醫保報銷必須是在藥品的適應癥範圍內。以ALK第壹代靶向藥物克唑替尼為例。醫保支付範圍“僅限於ALK(anaplastic lymphomakinase)陽性的局部晚期或轉移性非小細胞肺癌患者或ROS1陽性的晚期非小細胞肺癌患者。”
也就是說，患者使用了克唑替尼。如果要進行醫保報銷流程，必須有明確的基因檢測報告，證明患者有ALK或ROS1融合/重排陽性。如果沒有明確的基因檢測報告，是不能報銷的，只能自費承擔克唑替尼的治療費用。
此外，國家衛健委發布的《抗腫瘤新藥臨床應用指導原則》(2021版)也明確指出，有明確靶點的藥物在使用前必須遵循基因檢測的原則。用於檢測的儀器、設備、診斷試劑和檢測方法應當經國家藥品監督管理部門批準，特別是通過伴隨診斷驗證的方法。未經相關檢查不要盲目用藥。
雖然基因檢測是壹筆很大的費用，但是規範用藥，報銷壹些已經進入醫保的靶向藥還是很有必要的。但當基因檢測納入醫保後，患者將節省基因檢測的費用，從而大大減輕經濟負擔。
法律依據
中華人民共和國社會保險法
第二條國家建立基本養老保險、基本醫療保險、工傷保險、失業保險和生育保險等社會保險制度，保障公民在年老、患病、工傷、失業和生育時依法從國家和社會獲得物質幫助的權利。
第二十六條職工基本醫療保險、新型農村合作醫療和城鎮居民基本醫療保險按照國家規定執行。
第二十八條符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準和急診、搶救的醫療費用，按照國家規定由基本醫療保險基金支付。