天然藥物中的化學成分的復雜性主要體現在：某壹種天然藥物可能含有幾種類型的成分，而每壹個類型又可能含有少則幾種、多則十幾種、幾十種化學成分。
天然藥物中的化學成分
1、生物堿：是存在於生物體內的壹類含氮有機化合物，通常具有堿的性質，能與酸結合成鹽。生物堿具有多樣而顯著的生物活性，是天然藥物化學重要的研究領域之壹。
2、糖：是植物中普遍存在的化學成分，糖類又可分為單糖、低聚糖、多糖等。是植物中極性較大的化學成分，除多糖外，其他都易溶於水。天然藥物中常見的多糖有澱粉、菊糖、果膠、樹膠和黏液質等，是由10個以上單糖通過苷鍵聚合而成的高分子化合物，無壹般單糖的性質，在天然藥物化學成分的提取和精制中通常作為雜質而被除去。
3、醌類：是分子中具有醌式結構的壹類化合物，其中蒽醌類化合物數量較多。天然存在的醌類化合物母核上常具有酚羥基，呈壹定的酸性，在植物體內以遊離形式和糖結合成苷的形式存在。
4、黃酮類：是指兩個苯環通過中間三碳鏈連接而成的壹類化合物。該類化合物在植物體中多數與糖類結合成苷而存在，部分以遊離狀態存在。天然黃酮類化合物母核上常含有羥基、甲氧基、羥甲基、異戊烯氧基等取代基。這些助色團的存在，使該類化合物多顯黃色。因分子中多具有酚羥基，故顯酸性。黃酮類化合物在植物界分布廣泛，生物活性多樣。
天然藥物
天然藥物，是指經現代醫藥體系證明具有壹定藥理活性的動物藥、植物藥和礦物藥等。天然藥物不等同於中藥或中草藥。隨著社會的發展，人們越來越關註化學藥品給人類自身健康及生活環境帶來的負面影響；回歸自然、保護環境已成為壹種處理人類和環境關系的潮流思想。