西藥部分：
抗微生物藥 抗寄生蟲病藥 解熱鎮痛及非甾體抗炎鎮痛藥
麻醉用藥 維生素及礦物質缺乏癥用藥 營養治療藥
激素及調節內分泌功能藥 調節免疫功能藥 抗腫瘤藥
抗變態反應藥 神經系統用藥 治療精神障礙用藥
呼吸系統用藥 消化系統用藥 循環系統用藥
泌尿系統用藥 血液系統用藥 調節、水電解質及酸堿平衡藥
專科用藥 診斷用藥物 生物制品
中成藥部分：
西藥部分
抗微生物藥 抗寄生蟲病藥 解熱鎮痛及非甾體抗炎鎮痛藥
麻醉用藥 維生素及礦物質缺乏癥用藥 營養治療藥
激素及調節內分泌功能藥 調節免疫功能藥 抗腫瘤藥
抗變態反應藥 神經系統用藥 治療精神障礙用藥
呼吸系統用藥 消化系統用藥 循環系統用藥
泌尿系統用藥 血液系統用藥 調節、水電解質及酸堿平衡藥
專科用藥 診斷用藥物 生物制品
中成藥部分
內科用藥 外科用藥 婦科用藥
眼科用藥 耳鼻喉科用藥 骨傷科用藥
皮膚科用藥 民族藥
三、中藥飲片部分
1、單味或復方均不支付費用的中藥飲片及藥材
白糖參、朝鮮紅參、玳瑁、冬蟲夏草、蜂蜜、蛤蚧、狗寶、海龍、海馬、紅參、猴棗、琥珀、靈芝、羚羊角尖粉、鹿茸、馬寶、瑪瑙、牛黃、珊瑚、麝香、西紅花、西洋參、血竭、燕窩、野山參、移山參、珍珠（粉）、紫河車
各種動物臟器（雞內金除外）和胎、鞭、尾、筋、骨
2、單味使用不予支付費用的中藥飲片及藥材
阿膠、阿膠珠、八角茴香、白果、白芷、百合、鱉甲、鱉甲膠、薄荷、萊菔子、陳皮、赤小豆、川貝母、代代花、淡豆豉、淡竹葉、當歸、黨參、刀豆、丁香、榧子、佛手、茯苓、蝮蛇、甘草、高良姜、葛根、枸杞子、龜甲、龜甲膠、廣藿香、何首烏、荷葉、黑芝麻、紅花、胡椒、花椒、黃芥子、黃芪、火麻仁、核桃仁、胡桃仁、姜（生姜、幹姜）、金錢白花蛇、金銀花、桔紅、菊花、菊苣、決明子、昆布、蓮子、靈芝、蘆薈、鹿角膠、綠豆、羅漢果、龍眼肉、馬齒莧、麥芽、牡蠣、木瓜、南瓜子、胖大海、蒲公英、蘄蛇、芡實、青果、全蠍、肉蓯蓉、肉豆蔻、肉桂、山楂、桑椹、桑葉、沙棘、砂仁、山藥、生曬參、石斛、酸棗仁、天麻、甜杏仁、烏梅、烏梢蛇、鮮白茅根、鮮蘆根、香薷、香櫞、小茴香、薤白、飴糖、益智、薏苡仁、罌粟殼、余甘子、魚腥草、玉竹、郁李仁、棗（大棗、酸棗、黑棗）、梔子、紫蘇。
註:本目錄所列藥品均包括生藥及炮制後的藥材及飲片。
醫保目錄分國家、地方醫保目錄，每個省進入目錄定價的規則不太壹樣。地方目錄的藥當然執行地方目錄價格，但地方目錄也是參照國家目錄根據地方實際經審批確定的。