食品藥品監管局指藥品監督管理的行政主體，依照法定職權，對行政相對方是否遵守法律，法規，行政命令，決定和措施所進行的監督檢查活動。主要職能有：
（壹）貫徹執行國家和省有關食品、保健品、化妝品安全管理方面的法律、法規和行政規章，組織有關部門制定食品、保健品、化妝品安全管理的綜合監督政策、工作規劃並監督實施。
（二）依法行使食品、保健品、化妝品安全管理的綜合監督職責，組織協調有關部門承擔的食品、保健品、化妝品安全監督工作。
（三）依法組織開展對食品、保健品、化妝品重大安全事故的查處；根據市政府授權，組織協調開展全市食品、保健品、化妝品安全的專項執法監督活動；承擔保健用品監督及市場管理等相關職能；組織協調和配合有關部門開展食品、保健品、化妝品安全重大事故應急救援工作。
（四）綜合協調食品、保健品、化妝品安全的檢測和評價工作；會同有關部門制定食品、保健品、化妝品安全監管信息發布辦法並監督實施，綜合有關部門的食品、保健品、化妝品安全信息並定期向社會發布。
（五）貫徹執行國家和省有關藥品管理的法律、法規；依法監督實施藥品研究、生產、流通和使用方面的質量管理規範；組織開展藥品生產、經營質量管理規範認證工作。
（六）貫徹執行國家和省有關醫療器械管理的法律、法規；負責核發第壹類醫療器械產品註冊證書；監督實施醫療器械行業標準和生產質量管理規範。
（七）組織實施國家有關處方藥和非處方藥分類管理制度；負責藥品不良反應監測工作。
（八）監督實施國家藥品標準，監督檢驗藥品生產、經營企業和醫療機構的藥品質量，發布本市藥品質量公報；依法查處制、售假劣藥品、醫療器械等違法行為；依法核發零售企業的藥品經營許可證；負責藥品生產企業、藥品批發經營企業、醫療器械生產企業、醫療器械經營企業和醫療機構制劑許可的初審工作。
（九）依法監管放射性藥品、麻醉藥品、醫療用毒性藥品、精神藥品及特種藥械。
（十）負責進口藥品通關備案工作。
（十壹）實施執業藥師資格準入制度，組織執業藥師（含執業中藥師）資格考試及註冊工作。
（十二）監督管理中藥材專業市場。
（十三）會同有關部門監督檢查藥品、醫療器械廣告。
（十四）負責本系統的機構編制、幹部人事、勞動工資、教育培訓和精神文明建設工作。