縣級以上人民政府所屬的動物防疫監督機構(以下簡稱動物防疫監督機構)實施動物防疫和動物防疫監督。
鄉鎮動物防疫機構應當在縣級動物防疫監督機構的指導下，做好動物疫病的預防、控制和撲滅工作。
公安、工商行政管理、衛生、交通等部門應當按照各自的職責，配合做好動物防疫工作。第四條動物疫病實行預防為主的方針。
各級人民政府應當加強對動物防疫工作的領導，加強動物防疫檢疫隊伍建設，組織制定本行政區域內重大動物疫情防控預案和應急預案，逐步增加動物防疫經費，采取有效措施預防、控制和撲滅危害養殖業生產和人體健康的動物疫病。第五條縣級以上人民政府畜牧獸醫行政管理部門應當根據國家動物防疫規劃制定實施方案，報同級人民政府批準後實施。
對嚴重危害水產養殖生產和人體健康的動物疫病實行計劃免疫制度和強制免疫。動物疫病強制免疫和免疫動物標識的管理按照國家有關規定執行。第六條預防、控制、撲滅動物疫病所需的藥品、生物制品及相關物資應當妥善儲備，所需經費列入同級財政預算。
預防動物疫病所需的生物制品，由動物防疫監督機構按照國家規定統壹組織供應。第七條染疫動物及其排泄物和汙染物、染疫動物的產品、死亡或者不明動物屍體，必須按照國務院畜牧獸醫行政管理部門的有關規定處理，不得隨意處置。第八條運輸過程中，動物屍體、染疫動物以及墊料、糞便、汙染物必須在指定地點或者到達地點卸下，按照國家有關規定處理，所需費用由當事人承擔。禁止在運輸過程中遺棄或者出售動物屍體和染疫動物。第九條禁止轉移、加工、銷售經動物防疫監督機構隔離、封存和無害化處理的染疫動物、動物產品和動物屍體。第十條因科學研究、教學、防疫、生物制品生產等特殊需要。、從省外引進動物源性病原微生物和病料的，應當經省人民政府畜牧獸醫行政管理部門批準，有關單位應當按照國家有關規定嚴格管理，防止動物疫病傳播。第十壹條任何單位和個人發現染疫動物或者疑似染疫動物，應當及時向動物防疫監督機構或者鄉鎮動物防疫機構報告。動物防疫監督機構或者鄉鎮動物防疫機構應當采取控制措施，並立即派人進行調查。並按照國家有關規定向同級人民政府畜牧獸醫行政管理部門和上級動物防疫監督機構報告。
經調查確認發生動物疫情的，縣級以上地方人民政府畜牧獸醫行政管理部門應當及時派人趕赴現場，采集病料，調查疫源，診斷疫情，依照動物防疫法和國家有關規定劃定疫點、疫區、受威脅區，並及時向同級人民政府報告。疫情的公布應當嚴格按照國家有關規定執行，任何單位和個人不得隨意發布。
縣級以上人民政府畜牧獸醫行政管理部門或者衛生行政管理部門以及有關單位發現人畜共患疫病時，應當相互通報疫情，並及時采取控制、撲滅措施。第十二條縣級以上人民政府應當組織有關部門和單位對疫點、疫區采取下列措施:
(壹)對動物、動物產品的運載工具、圈舍、汙染場所、物品進行消毒；
(二)對染疫動物或者疑似染疫動物進行隔離、撲殺、無害化處理或者銷毀；
(三)無害化處理或者銷毀染疫或者疑似染疫動物的分泌物、排泄物、墊料、汙染物和產品；
(4)為未感染的動物接種疫苗，並指定圈養、放牧和奴役區。第十三條受威脅地區人民政府應當密切監測動物疫情動態，組織有關單位和個人對易感動物采取緊急免疫、消毒等預防措施，防止疫病的發生、傳播和蔓延。第十四條發生壹類、二類、三類動物疫情時，縣級以上地方人民政府應當依法迅速發布封鎖令，對疫區實施封鎖，並組織有關部門和單位采取強制控制、撲滅措施，迅速撲滅疫情。除本辦法第十二條規定的措施外，在封鎖地區還應當采取下列措施:
(壹)禁止染疫和疑似染疫動物及動物產品的交易和流出；
(二)禁止與動物疫病發生有關的動物、動物產品的交易和流出；
(三)禁止封鎖區以外的易感動物和與動物疫病發生有關的動物進入；
(4)對交通路口的人員、車輛及相關物品采取強制消毒等措施。