（壹）進出口貨物的申報
進出口貨物的收發貨人或者其代理人，在貨物進出口時，應當在海關規定的期限內，按照海關規定的格式填制進出口貨物報關單，並隨附有關貨運、商業單證，同時向海關提供進出口貨物的批單，向海關申報。海關申報的主要單證如下：
進口貨物報關單。壹般填寫壹式兩份（北京海關要求報關單份數為三份）。報關單填寫項目要準確、完整、字跡清楚，不能用鉛筆填寫；報關單各欄目中，凡海關規定有統計代碼的欄目，以及有稅號和稅率的欄目，由報關員用紅筆填寫；每份報關單只限填寫四種貨物；如發現沒有的情況或其他情況需要更改報關單內容的，應主動及時向海關提交更改單。
出口貨物報關單。壹般填寫壹式兩份（北京海關要求壹式三份）。填寫要求與進口貨物報關單基本相同。如果填寫有誤或需要更改填寫內容而未及時主動更改的，出口報關單發生通關差錯後，報關單位應在3日內向海關辦理更正手續。
隨報關單提交的貨運單證和商業單證。凡通過海關辦理進出口貨物報關手續的，必須在向海關填制報關單的同時，提交有關貨運單證和商業單證，接受海關對單證是否相符的審核，並經海關審核蓋章後，作為提取或裝運貨物的憑證。與報關單同時接受海關審驗的貨運和商業單證有：海運進口提單；海運出口裝貨單（需海關單位蓋章）；陸運、空運提單；貨物發票（其份數比報關單少壹份，需海關單位蓋章等）；貨物裝箱單（其份數與發票份數相等，需海關單位蓋章）等。需要註意的是，如果海關認為有必要，報關單位還應提交貿易合同、訂貨卡、原產地證書等。此外，對按照規定享受減征、免征或者減免稅的貨物，應當向海關提出申請並已辦結手續的，憑報關單提交有關單證。
進（出）口貨物許可證。進出口貨物許可證制度，是進出口貿易管理的壹種行政保護手段。我國和世界上大多數國家壹樣，也采用這種制度對進出口貨物、物品實行綜合管理。必須向海關提交進出口貨物許可證的商品並不是固定不變的，而是由國家主管部門隨時調整和公布。凡國家規定應當辦理進出口貨物許可證的商品，報關時必須提交由外經貿管理部門簽發的進出口貨物許可證，並經海關查驗合格後方可放行。但外經貿部所屬進出口公司、國務院批準經營進出口業務的部分所屬工貿公司和各省（直轄市、自治區）所屬進出口公司，在批準的經營範圍內進出口商品的，視為特許進出口，免領進出口許可證，只憑報關單向海關申報即可；經營範圍以外的進出口商品才需要提交許可證。
商檢證。海關責成報關單位簽發商檢證書，壹方面是為了監督已經接受法定檢驗的商品接受商檢機構的法定檢驗；另壹方面是為了取得進出口商品征稅、免稅、減稅的依據。根據《中華人民共和國***和國進出口商品檢驗法》和《商檢機構實施檢驗的進出口商品種類表》的規定，列入《法定檢驗的進出口商品種類表》的商品，應當在報關前向商檢機構申報檢驗。報關時，進口貨物海關憑商檢機構出具的檢驗證書或者在進口貨物報關單上加蓋驗訖章。
除上述單證外，國家規定的其他進出口監管貨物，報關單位必須提交海關主管部門出具的具體進出口貨物的報關單，經海關查驗合格後予以放行。如食品衛生檢驗、藥品檢驗、動植物檢疫、出口文物簽註、金銀及其制品的管理、珍貴稀有野生動物的管理、進出口射擊運動、狩獵槍支彈藥和民用爆炸物品的管理、進出口音像制品的管理等均列入其中。
（二）進出口貨物的查驗
進出口貨物，除海關總署特別許可查驗外，應當接受海關查驗。查驗的目的是核對報關單內容與實際到貨是否壹致，有無錯報、漏報、瞞報、偽造等情況，審查進出口貨物是否合法。
海關查驗貨物應當按照海關規定的時間、地點進行。如有特殊原因，事先征得海關同意，海關可在規定的時間、地點以外派員查驗。申請人應提供往返地點的交通和食宿，並支付費用。
海關查驗貨物時，必須要求貨物收發貨人或者其代理人到場，並按照海關的要求負責辦理搬移貨物、開箱查驗貨物包裝等工作。海關認為必要時，可以前去開箱查驗、復驗或者提取樣品，貨物保管人應當在場見證。
查驗貨物時，因海關關員的責任造成查驗貨物損壞的，海關應當按照規定賠償當事人的直接經濟損失。賠償方式：由查驗關員填寫《中國人民***和國家海關查驗貨物、物品損壞報告書》壹式兩份，查驗關員和當事人雙方簽字，各流轉壹份。 雙方***用約定的貨物、物品損壞情況雙方簽字。雙方***憑約定的貨物損壞程度或修理費用（必要時可憑公證機關出具的鑒定證書確定），以海關審定的完稅價格作為確定賠償金額的依據。賠償金額確定後，由海關填寫《中國人民***和國家海關損壞貨物、物品賠償通知書》，當事人憑《通知書》在三個月內到海關領取賠償金或通知海關撥付銀行賬號，逾期海關不予賠償。賠償壹律以人民幣支付。
（三）進出口貨物的放行
海關對申報進出口的貨物，經審查報關單證、查驗實際貨物，並依法辦理貨物征稅手續或者免稅手續後，在有關單證上加蓋放行章，由貨主或者其代理人提取或者裝運貨物。至此，海關對進出口貨物的監管就算結束了。
此外，進出口貨物因各種原因需要海關特殊處理的，可以向海關申請擔保放行。海關對擔保的範圍和方式有明確規定。
稍微詳細壹點的如下：
進口報關的基本程序：接受報關→審單→驗貨→辦理征稅→通關。
1.憑換發的提單（1、3）及所附報關單據前往海關報關。報關單據：提單（1、3聯）聯合報關，在加蓋白色放行章後，寄回進口商作為交貨憑證。正本裝箱單、正本發票、合同、進口報關單壹式兩份、正本報關委托協議、海關監管條件中涉及的各類單證。
註：
（1）收到客戶提供的全套單證後，應先確認貨物的商品編碼，再核對海關稅則，確認進口稅率，確認貨物需要哪些監管條件，如需要做各種檢驗，應在報關報檢前向有關機構申報。報檢所需單證：報檢申請表、發票正本、合同、進口報關單兩份。
（2）換單時，應督促船代及時向海關傳遞艙單，如有問題，應及時與海關艙單處取得聯系，確認艙單是否傳遞給海關。
（3）海關要求開箱查驗貨物時，應提前與堆場取得聯系，並調配機器將查驗的集裝箱轉運至海關指定的堆場。(提前與場站確認轉箱費、掏箱費）。2.如果貨物需要法檢，就要辦理貨檢手續。如需商檢，則需持進口商檢申請表（加蓋公章）和兩份報關單辦理報關登記手續，並在報關單上加蓋商檢登記情況章，以便通關。在最終目的地辦理貨檢手續。如需移廠查驗，也可在報關前憑發票合同和裝箱單前往代報關報檢機構申請查驗，在報關單上加蓋放行章以便通關，查驗手續可在堆場辦理後通關。
3.通關放行要到三檢大廳進行三檢。到大廳的代理報檢機構提供箱單、發票、合同申報單，由其代理報檢。查驗完畢後，可到大廳統壹窗口繳費。並在白色提單上加蓋三檢放行章。
4、辦理完三檢手續後，到港池大廳繳納港雜費。結清港雜費後，港口將提單交還發貨人提貨。
5.所有手續辦妥後，即可通知事先聯系好的堆場提貨。
註意事項：
（1）首先要與港池調度室取得聯系，安排好計劃。
（2）根據提箱數量與堆場聯系足夠的車輛，盡量按港口要求的時間內提貨，以免產生轉堆存的費用。
（3）接箱過程中，要與堆場有關人員核對箱體有無明顯損壞，如有損壞，要請港方在設備交接單上簽字。
6、空閑期間應及時清空重箱，避免重箱提到堆場後滯留。
7、貨物提走後，從堆場取回設備交接單，證明箱體無損，並到船公司或船代公司取回押箱費用。