藥品註冊核查結果判定原則中屬於不通過如下：
1、註冊申請資料虛假的；
2、註冊申請資料內容不符合規定的；
3、藥品註冊檢驗報告不規範或者藥品註冊檢驗報告不符合規定的；
4、生產現場檢查或者樣品檢驗不符合規定的；
5、生產企業的質量管理體系不符合要求的；
6、藥品的安全性、有效性得不到保障的。
這些不通過的情況，涉及到了藥品註冊申請的各個方面，其中包括申請資料的真實性、規範性，藥品註冊檢驗的準確性，生產現場檢查和樣品檢驗的符合性，以及生產企業的質量管理體系是否符合要求等。這些環節都是藥品註冊核查的重要環節，任何壹個環節出現問題，都會導致核查不通過。
除此之外，藥品的安全性和有效性也是藥品註冊核查的重要內容。如果藥品的安全性、有效性得不到保障，即使其他環節都符合要求，該藥品的註冊申請也會被判定為不通過。這是為了保證進入市場的藥品能夠安全、有效地治療疾病，保障公眾的健康和安全。
藥品註冊核查結果判定原則中，不通過的情況多種多樣，涉及到的環節也非常多。因此，藥品註冊申請人在申請藥品註冊時，需要認真了解和遵守相關法律法規和規定，確保申請資料的完整性和準確性，保證樣品的質量和安全性，建立健全的質量管理體系，以確保藥品註冊申請能夠順利通過核查。
同時，監管部門也需要對藥品註冊申請進行嚴格的核查和審批，對不符合規定的申請及時進行處理和糾正，對存在問題的生產企業進行監督和整改，確保進入市場的藥品質量和安全得到保障。