藥品追溯管理制度主要包括以下內容：電子質量追溯系統、時空計算機系統、系統追溯、票據追溯。
1、企業應建立時空計算機管理系統作為藥品質量追溯系統，同時將藥品電子監管系統作為賦藥品電子監管碼的產品的電子質量追溯系統。
2、時空計算機系統建立的質量控制追溯功能有質量管理、采購管理、收貨驗收管理、儲存管理、銷售管理、出庫復核管理、運輸管理、財務管理、退貨管理，對購進藥品的供貨單位、購貨單位、購進品種的資質合法性的審程序。
3、系統追溯：建立采購、收貨、驗收、儲存、養護、出庫復核、銷售等經營全過程質量管理及質量控制要求的計算機系統，各類數據的錄入、修改、保存等操作應當符合授權範圍、操作規程和管理制度的要求，保證數據原始、真實、準確、安全和可追溯。
4、票據追溯：仔細核對相關票據，確保票、賬、貨、款壹致，實現可追溯。
藥品追溯管理制度作用
1、提高藥品質量：通過實施藥品追溯管理制度，企業可以對藥品的采購、儲存、銷售、運輸等環節進行有效控制，確保藥品質量。
2、保障用藥安全：藥品追溯管理制度有助於追蹤藥品來源和去向，壹旦發現問題，可以迅速召回相關藥品，降低患者使用問題藥品的風險。
3、強化責任追究：藥品追溯管理制度使藥品的生產、經營、使用等各環節責任更加明確，有利於在發生問題時追溯責任，確保責任人承擔相應責任。
4、提升企業形象：藥品追溯管理制度的實施有利於提高企業的質量管理水平，提升企業形象，增強消費者信任。