聯合用藥，要有明確的適應癥。出現下列情況，可采用聯合用藥。
（1）、病情危機或病因不明的嚴重感染。
（2）、單壹抗菌藥物難以控制的耐藥菌或混合感染。
聯合用藥可產生協同、累加、無關和拮抗四種結果。聯合用藥的目的是為了獲得協同，即提高藥物療效，擴大抗菌鋪，減輕毒副作用和防止或減緩耐藥菌形成。如聯用藥物同時作用於細菌的幾個主要代謝途徑，常可取得有效的協同效果。
青黴素類或頭孢菌素類與氨基糖甙類聯用，甲氧芐氨嘧啶與某些磺胺類藥物合用，對某些致病菌常可獲得協同作用。林可黴素與甲硝噠唑用於抗厭氧菌，並與氨基糖甙類合用抗G菌。某些半合成青黴素與妥布黴素或慶大黴素，用於抗綠膿桿菌。β-內酰胺類和酶抑制劑抗細菌鈍化酶等。另外，已證實喹諾酮類與β-內酰胺類、氨基糖甙類、林可黴素和甲硝噠唑，在體外亦具有協同作用。
壹般而言，殺菌性藥物聯用通常是協同的，而抑菌性藥物，以累加方式起作用。靜止期殺菌劑與速效抑菌劑聯用，可產生累加或協同。應避免速效抑菌藥物先於或同時與繁殖期殺菌性藥物聯用，因細胞生長受到抑制而影響殺菌效果，出現拮抗。這是聯合用藥的壹般準則。也有很多例外，如羧芐青黴素、羧噻吩青黴素能與氨基糖甙類發生相互作用而使之滅活。氯黴素能幹擾許多殺菌性藥物的作用，還與大環內酯類、林可黴素類競爭相同的核糖體結合位點而不能合用。
2、配伍禁忌
配伍禁忌，是為了防止藥物聯用時出現拮抗，即療效降低，不良作用增加。根據抗菌藥物的特性大致可將其歸納為以下幾種。
（1）、兩種抗G+菌或G-菌藥物配伍，不能擴大抗菌譜，會增加毒性。
（2）、廣譜類與其他抗菌藥物配伍，會增加出現拮抗效率。
（3）、化學結構或作用機理類同藥物配伍，難以提高藥效，並易產生交叉耐藥。
（4）、酸性類與堿性類藥物配伍，會相互作用，降低藥效。
（5）、毒副作用類同藥物配伍，會增加毒性。
另外，還應關註治療藥物與輔助藥物的配伍禁忌。如速尿、利尿劑能增強頭孢噻啶的腎毒性和氨基糖甙類的耳毒性；抗酸藥可幹擾喹諾酮類、四環素類在胃腸道的吸收；尿液致酸劑可增加磺胺結晶尿的危險性；鐵制劑能與四環素類絡合而降低血藥濃度等。
馬屬動物不宜使用的藥物：四環素類藥物（嚴重腹瀉），大環內酯類藥物（嚴重胃腸功能紊亂），林可黴素（致命結腸炎）。
泰樂菌素可能引起豬直腸粘膜水腫、腹瀉；貓對前庭毒性敏感，不用氨基糖甙類