此外，深圳市三九醫藥貿易有限公司在20多年的市場實踐中，形成了壹套行之有效的制度化、流程化管理體系。特別是2000年以來，三九醫藥貿易大力實施管理變革，先後實施了企業資源計劃、系統產品管理、知識管理、現代人力資源管理等壹系列管理項目。管理水平不斷提高。
此外，深圳市三九醫藥貿易有限公司始終堅持 "以人為本 "的管理理念，建立了完善的各級員工培訓計劃，不斷提高員工的職業素養和工作能力；在人才選拔方面，以 "業績第壹 "的文化理念和完善的績效考核為基礎，開辟了多形式的職業發展通道，讓優秀員工有機會在公司的事業中發展壯大。在人才選拔方面，以 "績效優先 "的文化理念和完善的績效考核為基礎，開辟多種形式的職業發展通道，使優秀人才脫穎而出，為組織能力的提升和公司的持續發展提供動力；在激勵機制方面，公司按照市場化原則，不斷豐富激勵產品，將激勵產品與績效增長掛鉤，促進員工薪酬福利水平在外部市場的公平性。三九醫貿不是壹個單純追求經濟效益最大化的經濟實體，我們將企業利益與社會整體利益緊密結合在壹起。
此外，公司始終關註產品質量，建立了完善的質量管理體系，全面實施GSP，控制經營的各個環節，加強藥品經營質量管理，決不允許壹件有質量問題的藥品進入公司的營銷網絡，公司上下每壹位員工的心中都秉承著 "服務社會，回報大眾，讓健康屬於妳們每壹個人"！公司員工抱著 "服務社會，回饋大眾，讓健康伴隨每壹個人 "的社會責任感。