藥物按來源可分為天然藥物、人工合成藥物、生物制品藥三類。
壹、天然藥物
天然藥物，是指經現代醫藥體系證明具有壹定藥理活性的動物藥、植物藥和礦物藥等。天然藥物不等同於中藥或中草藥。隨著社會的發展，人們越來越關註化學藥品給人類自身健康及生活環境帶來的負面影響；回歸自然、保護環境已成為壹種處理人類和環境關系的潮流思想。
包括植物藥、動物藥和海洋藥物的天然藥物的研究和開發順勢大力發展，對天然藥物的各種人為禁制也趨於寬松。
二、人工合成藥物
人工合成藥物是用化學合成或生物合成等方法制成的藥物。化學合成包括有機合成和無機合成。生物合成包括全生物合成和部分生物及部分化學合成。
藥物合成在醫藥工業中占極重要的地位。合成藥物在醫療實踐中被廣泛應用。有些合成藥物與天然藥物的結構很相似，但不完全相同，例如優奎寧與奎寧相似，但不完全相同。有些合成藥物則與天然藥物毫無關系，例如阿司匹林、呋喃西林等。
三、生物制品藥
生物制品是應用普通的或以基因工程、細胞工程、蛋白質工程、發酵工程等生物技術獲得的微生物、細胞及各種動物和人源的組織和液體等生物材料制備的，用於人類疾病預防、治療和診斷的藥品。
生物制品不同於壹般醫用藥品，它是通過刺激機體免疫系統，產生免疫物質（如抗體）才發揮其功效，在人體內出現體液免疫、細胞免疫或細胞介導免疫。人用生物制品包括：細菌類疫苗（含類毒素）、病毒類疫苗、抗毒素及抗血清、血液制品、細胞因子、生長因子、酶等。