骨髓增生異常綜合征的治療最關鍵的是要明確病因，對癥治療。骨髓增生異常綜合征是壹組起源於造血幹細胞的異質性髓系克隆性疾病，以髓系細胞分化發育異常為特征。治療骨髓增生異常綜合征的關鍵是改善血液環境，恢復正常造血功能。
壹、中醫辨證論治：
1、熱毒熾盛型骨髓增生異常綜合征：
治法：清熱解毒活血。
藥用：銀花、連翹、石膏、知母、生地、丹皮、黃芩、黃連、公英、青黛、白英、地丁。
2、血瘀痰核型骨髓增生異常綜合征：
治法：活血化瘀，軟堅散結。
藥用：川芎、當歸、赤芍、紅花、半夏、山慈菇、莪術、川貝、牡蠣、鱉甲、黃芪、苦參。
二、清髓凈血療法：
清髓凈血療法配合中藥發揮補腎填精、益氣養血、溫補元陽、平衡免疫的調節作用，從而改善外周血和骨髓的環境，促進造血機體正常功能的恢復。
三、氣功療法：
由於骨髓增生異常綜合征的病程發展壹般較慢，宜以 "內陽功 "配合治療。練習時註重呼吸調息，並配合默念詞句，以誘導入靜，意守丹田。坐姿、站姿、立姿均可。此功使大腦入靜，並對五臟六腑的運動特點、消化功能、血液循環都有調整作用，根據骨髓增生異常綜合征的日常情況，可作1～3次，每次20～30分鐘即可。