評標專家對投標報價進行評審和比較的基本著眼點，是投標報價是否合理。在對投標報價進行評分前，應當剔除明顯偏高或者偏低的不合理報價。所謂明顯偏高，是指在政府指導價沒有上調的情況下投標報價高於招標人的加權平均購入價。集中采購導致供應商銷售批量擴大、成本下降，按照薄利多銷的原則，合理的投標報價應當低於招標人分散采購時平均價格。明顯偏高的價格是不合理投標報價，招標人應當拒絕。所謂明顯偏低，是指投標人以低於成本的價格報價。投標報價低於投標人的個別成本，是違反價格法的不正當競爭行為，招標人也應當拒絕。在評分前剔除不合理報價，需要招標人認真做好評標前的準備工作，為評標專家提供真實的藥品采購價格歷史資料，讓評標委員會在判斷投標報價是否合理時有所遵循。
投標報價是客觀評價指標。對評標委員會認為合理的投標報價進行評定分數，應當依據《文件範本》第3.2.2條的規定，采用以下方法進行：
壹、位置法。將投標報價由低到高排序後依位次評分，報價最高的得最低分，報價最低的得最高分，其他報價依序對應相應分數。
二、平均值法。取所有投標報價的平均值，按投標報價偏離平均值的比率評分，低於平均值最多的得最高分，高於平均值最多的得最低分。其余報價依其與平均值的偏離幅度分別評分。
三、也可以采取其他方法計算價格分。如比率法。報價最高的得最低分，報價最低的得最高分，其余報價依其與最低價的偏離幅度評定分數。
以上三種方法，能夠帶來價格標準對中標的不同影響。位置法評分過程簡便，在投標人較少、報價較接近時對價格分能夠起到放大作用。平均值法和比率法評分過程復雜，但對價格的評分比較精確，在投標人較少、報價較接近時對價格分的評分不能拉開距離，使價格分對中標的影響有壹定限制作用。壹般情況下，比較註重價格，價格降幅空間大、投標人相對較少的招標項目應當采用位置法。比較註重質量，價格降幅空間不大、投標人相對較多的招標項目應當采用平均值法或者比率法。