中華人民共和國衛生部二惡英檢測專業實驗室，深圳市醫學重點實驗室。實驗室累計投入近千萬元，建立了以博士、碩士為主體的技術梯隊，配備了氣相色譜/高分辨雙聚焦磁質譜聯用儀，完成了以二惡英化合物為代表的持久性有機汙染物的超痕量檢測，可開展國際上毒性最強的十七種二惡英異構體（PCDD/Fs）、三十七種多氯聯苯異構體的常規檢測。可對國際上十七種毒性最強的二惡英異構體（PCDD/Fs）、三十七種多氯聯苯（PCBs）和七種多溴聯苯醚（PBDEs）進行定性和定量檢測，可分析的樣品基質包括：食品、食品添加劑、飼料，環境樣品中的垃圾焚燒爐煙氣、飛灰、基質、土壤、水和化工產品等。近年來，承擔和主持國家自然科學基金、廣東省和深圳市科研項目8項；參與國家科技部十五攻關、國家973、國家食品安全關鍵技術等國家級科研項目8項；獲中華醫學科技獎二等獎1項、深圳市科技進步獎三等獎1項；發明和發表科研課題1項、科研項目1項。曾獲中華醫學科技獎二等獎、深圳市科技進步三等獎，申報發明專利 1 項。主編出版學術專著1部，發表學術論文30余篇，其中SCI論文6篇。此外，學校具有碩士研究生自主招生資格和博士研究生合作招生資格。已培養畢業博士、碩士研究生10余名。在生態安全和食品安全保障方面發揮了重要作用。
2.健康毒理實驗室
廣東省 "十壹五 "醫學重點專科、深圳市市級重點實驗室、深圳市醫學重點實驗室。實驗室現為中國毒理學會生化與分子毒理學專業委員會、廣東省預防醫學會保健毒理學專業委員會掛靠單位、中山大學博士後流動站科研基地、深圳市博士後創新基地。實驗室已形成以博士、碩士為主的人才梯隊和研究團隊。研究重點是化學汙染物對機體損傷的分子機制、生物標誌物及其適應和耐受機制。實驗室帶頭人莊誌雄教授是中國毒理學會理事長，中山大學、中南大學特聘教授、博士生導師。實驗室現擁有2200多萬元的先進設備，用於細胞、基因組、表觀基因組、蛋白質組和實驗動物的整體水平檢測和研究，以及廣東省科技廳頒發的SPF級實驗動物使用許可證和普通實驗動物使用許可證的實驗動物中心。實驗室還負責接受客戶委托進行食品、化妝品、消毒劑、壹次性衛生用品和化學品的毒性試驗和安全性評價。近五年來，實驗室共承擔國家、省、市科研項目41項，其中國家自然科學基金項目10項（獨立承擔8項，合作單位2項），國家973計劃項目2項（子課題承擔單位）、國家 863 計劃項目 1 項（合作單位），省自然科學基金項目 5 項（獨立承擔 4 項，合作單位 1 項），省衛生廳項目 2 項，市科技計劃項目 2 項，市科技計劃項目 1 項（合作單位）。2004 年以來，共獲得國家、省、市科技成果獎 12 項，其中廣東省科技進步特等獎 1 項，廣東省科技進步二等獎 2 項，中華醫學科技二等獎 1 項、廣東省科學技術三等獎 1 項，深圳市科技創新獎 3 項，深圳市科技進步壹等獎 2 項，深圳市科技進步壹等獎 1 項，深圳市科技進步壹等獎 2 項。深圳市科技創新獎、深圳市科技進步獎、深圳市科技進步獎、深圳市科技進步獎。在國家級刊物上發表學術論文375篇，在SCI收錄刊物上發表論文22篇，在國際會議上發表論文13篇。培養畢業博士生20名，碩士生23名，博士後2名。
3.分子生物學實驗室
深圳市醫學分子生物學重點實驗室主要從事熱帶病疫苗和診斷試劑、慢性非傳染性疾病分子流行病學、人類和動物****，以及腫瘤防治等方面的研究與開發。擁有集熱帶病科研、診斷、教學、防控為壹體的技術平臺，具有獨立招收碩士研究生、合作招收博士研究生和博士後流動站的資格。目前承擔國家自然科學基金、廣東省自然科學基金、深港創新基金、深圳市科技計劃重點項目等資助的科研項目。主要研究方向為1）中華黃種人外顯子相關基因組研究；2）中華黃種人中風發病相關功能基因及基因治療研究；3）食品汙染物現場快速診斷生物傳感器及其復合金標色譜試劑盒的研制；4）腸毒素對癌癥的預防和治療作用研究；5）廣州管圓線蟲診斷性循環抗原單克隆抗體的制備及其應用研究；6）弓形蟲病綜合防治技術研究。近5年來，在國內外發表學術論文240余篇，其中在《Emerging and Infectious Diseases》、《Infection and Immunity》、《BBC》、《Cancer Research》、《Internationl Parasitology》、《parasitol》、《Immunity》、《parasitol Res》等國際有影響的刊物上發表論文多篇。 獲多項國家專利和省市科技成果獎。為國家培養博士、碩士研究生近50名。
4、艾滋病研究實驗室
深圳市衛生系統重點實驗室，衛生部艾滋病確證實驗室。承擔著全市艾滋病流行病學監測與疫情控制、實驗室篩查與確認、治療藥物信息管理、相關技術研究與推廣、政策研究等工作。目前已形成了壹支以高級職稱、高學歷人才為主體的人才隊伍，擁有流量計、全自動核酸和蛋白質提取工作站等大型儀器設備。近三年來，實驗室承擔了國家、省、市級科研項目和國際合作項目20余項，主要方向包括：1：艾滋病相關人群調查、分子流行病學、病毒學基礎研究以及母嬰傳播阻斷、耐藥性分析等。實驗室已發表SCI論文近10篇，申報國家發明專利1項。目前，實驗室已與國內外十多所著名高校和科研機構建立了緊密的合作關系。
5.轉基因研究實驗室
該實驗室是全國疾控系統中為數不多的可以從事轉基因檢測和研究的單位之壹。該實驗室投資 1000 多萬元建成。現有食品衛生與安全、營養與健康、基因工程、分子生物學等相關專業技術人員，主要開展轉基因生物和轉基因食品安全風險評估的標準研究，承擔廣東省科技廳和衛生廳、深圳市科技局的轉基因食品安全檢測技術研究工作。獲 "轉基因生物檢測 "國家發明專利2項，制定轉基因生物安全要求與評價、轉基因食品檢測方法與安全要求等深圳市和廣東省地方標準6項，主編出版相關學術專著4部，發表相關研究論文33篇，其中SCI收錄3篇，獲廣東省科技進步三等獎1項。曾獲廣東省科技進步三等獎1項，深圳市科技創新獎2項。
6、微生物參考實驗室
廣東省 "十壹五 "醫學重點專科、深圳市醫學重點實驗室；擁有3名享受政府特殊津貼的專家和壹批高級職稱、高學歷的技術人員為主的專業隊伍，配備了壹批國內先進的生物安全實驗室和近2000萬的先進儀器設備。實驗室配備了壹批國內先進的生物安全實驗室和近20萬臺各類先進儀器設備，建立了較為完善的免疫學、病原學、細胞生物學和基因組學檢測與研究平臺，為我市病原微生物和SARS、禽流感、甲型H1N1等各類傳染病的應急處理工作提供實驗室診斷和參考檢測服務。近5年來，主持國家自然基金、國家科技重大專項、省市科研項目20余項，獲中華醫學獎多項，省市科研成果及國家專利3項。
7、理化檢驗實驗室
實驗室擁有壹支具有高級技術職稱和博士、碩士學位的專業隊伍，配備有液相色譜/串聯質譜、液相色譜/ICP-MS聯用氣相色譜、氣相色譜等大型精密分析儀器20余臺件。集常規檢測和新技術、新方法研發於壹體，開展了三聚氰胺、蘇丹紅、孔雀綠、丙烯酰胺等 400 多個檢測項目。還開展了場所及健康相關項目的健康危害預測、預警和分析；碘缺乏病和食品營養素檢測；總放射性α、β檢測；負責突發公共****、衛生事件的應急檢測。近五年來，承擔國際原子能機構（IAEA）、廣東省自然科學基金、廣東省醫學科學基金項目和深圳市科技基金項目24項，參與制定國家標準19項，獲深圳市科技創新獎、深圳市標準創新獎各1項。