壹、帳務處理及涉及增值稅的問題：
1、存貨盤盈
根據“存貨盤存報告單”或“存活盤點表”所列金額
借:庫存商品等
貸:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
盤盈的存貨,通常是由日常收發計量或計算上的差錯所造成的,盤盈的存貨,可沖減管理費用,按規定手續報經批準後,會計分錄如下:
借:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
貸:管理費用
2、存貨盤虧
根據“存貨盤存報告單”或“存貨盤點表”
借:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
貸:庫存商品等
增值稅方面，根據《中華人民***和國增值稅暫行條例》以及《中華人民***和國增值稅暫行條例實施細則》規定，企業發生非正常損失的購進貨物，其進項稅額不得從銷項稅額中抵扣。如果企業在貨物發生非正常損失之前，已將該購進貨物的增值稅進項稅額實際申報抵扣，則應當在該批貨物發生非正常損失的當期，將該批貨物的進項稅額予以轉出。對於購進的貨物、在產品、產成品發生非正常損失引起盤虧存貨應負擔的增值稅,應壹並轉入“待處理財產損溢”科目.
由於樓主購進原材料為免稅的，因此不涉及這方面，但對原材料進行加工制造過程中耗用的其他材料的進項稅額應作進項轉出處理。
借:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
貸:應交稅金——應交增值稅(進項稅額轉出)
對於盤虧的存貨應根據造成盤虧的原因,分別處理,屬於定額內損耗以及存貨日常收發計量上的差錯,經批準後轉作管理費用 。
借:管理費用
貸:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
對於應由過失人賠償的損失,應作如下分錄:
借:其他應收款
貸:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
對於自然災害等不可抗拒的原因而發生的存貨損失,應作如下分錄:
借:營業外支出——非常損失
貸:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
對於無法收回的其他損失,經批準後記入“管理費用科目”
借:管理費用
貸:待處理財產損溢——待處理流動資產損溢
二、企業所得稅稅前扣除問題
根據《企業財產損失所得稅前扣除管理辦法》（國家稅務總局令2005年第13號）規定：
財產損失按申報扣除程序分為自行申報扣除和經審批扣除兩種：
存貨在因銷售、變賣、正常損耗發生的正常損失，在證據確鑿的情況下，壹律不再需要審批，企業在有關財產損失實際發生當期申報扣除即可；
而需經稅務機關審批才能在企業所得稅前扣除的非正常存貨損失，僅指“因自然災害、戰爭等政治事件等不可抗力或者人為管理責任”導致的存貨損失。
企業所得稅方面，對於因“管理不善”記入“管理費用”和因“自然災害”記入“營業外支出”的存貨非正常損失，如果具備第13號令中規定認定的證據，經稅務機關審查批準後，準予在當期稅前扣除。
對盤虧的存貨，扣除責任人賠償後的余額部分，依據下列證據認定損失：存貨盤點表，中介機構的經濟鑒證證明，存貨保管人對於盤虧的情況說明，盤虧存貨的價值確定依據（包括相關入庫手續、相同相近存貨采購發票價格或其他確定依據），企業內部有關責任認定、責任人賠償說明和內部核批文件；
對報廢、毀損的存貨，其賬面價值扣除殘值及保險賠償或責任賠償後的余額部分，依據下列證據認定損失：單項或批量金額較小的存貨由企業內部有關技術部門出具技術鑒定證明，單項或批量金額較大的存貨，應取得國家有關技術部門或具有技術鑒定資格的中介機構出具的技術鑒定證明，涉及保險索賠的，應當有保險公司理賠情況說明，企業內部關於存貨報廢、毀損情況說明及審批文件，殘值情況說明，企業內部有關責任認定、責任賠償說明和內部核批文件；
對被盜的存貨，其賬面價值扣除保險理賠以及責任賠償後的余額部分，依據下列證據認定損失：向公安機關的報案記錄，公安機關立案、破案和結案的證明材料，涉及責任人的責任認定及賠償情況說明，涉及保險索賠的，應當有保險公司理賠情況說明。