1、辦公室
負責編制本區衛生事業發展規劃和年度工作計劃，並組織實施；根據局領導要求，組織起草或審核以區衛生局、區衛生局辦公室名義發布的文件；負責起草衛生工作總結、情況匯報、局領導部分講話稿和各類公文；負責區人大代表書面意見和政協提案的辦理工作；負責本區衛生統計、網絡直報，以及衛生統計數據分析與利用等工作；負責局機關文書檔案管理，以及基層單位文書檔案工作的指導和檢查等工作；負責局機關會務、機動車輛、辦公用品和總務管理，以及對外聯系、接待等工作；負責本系統基本建設、社會治安綜合治理、安全生產，以及局直屬單位人口與計劃生育、愛國衛生、綠化管理。
負責人：殷 浩
2、財務審計科
負責編制本區衛生經費預算、決算和年度衛生經費預算調整方案，會同區財政局組織落實公立醫療機構和社區衛生服務中心收支兩條線預算管理工作，審核管理基層單位年度預算執行情況；負責基層單位醫療收費、物價政策，以及財務、票據管理等執行情況的監督檢查和指導工作；負責基層單位國有資產的管理和審核，以及政府采購項目執行情況的監督管理工作；負責本系統基層單位內部審計工作；負責局機關會計核算、財務管理等工作。
負責人：苗水生
3．醫政管理科
負責制定本區醫療、醫教、醫學科研發展規劃和年度計劃，並組織實施；承擔本區醫療機構醫療服務的監管工作，建立醫療機構醫療質量評價和監督體系，組織開展醫療（護理、醫技）質量、安全、服務監督和評價等工作，依法管理本區醫療機構內部臨床藥事管理工作；負責本區中醫藥工作發展規劃和中醫藥人才培養計劃的制定和實施；負責本區衛生應急工作，編制衛生應急預案，指導實施突發公***衛生事件預防控制與應急處置；負責本區重大活動醫療衛生保障工作；負責本區婦幼衛生規劃制定和實施，以及婦幼保健綜合管理和監督，促進婦幼衛生事業發展。
負責人：楊宏仁
4、疾病預防控制科
負責本區傳染病和慢性非傳染性疾病防治規劃和年度工作計劃制定和實施，組織實施國家免疫規劃，依法監測傳染病，建立預警機制，防止和控制疫情的暴發和蔓延，組織開展全民健康教育與促進；承辦區公***衛生聯席會議、區防治艾滋病工作委員會的具體工作，以及組織協調精神衛生相關工作；負責制定本區社區衛生發展規劃，組織實施社區衛生服務體系建設，以及社區衛生服務管理及協調等工作。
負責人：張 穎
5、衛生監督科
負責本區衛生監督執法工作計劃制定，並組織實施；負責有關公***衛生類和醫政類衛生行政許可和行政處罰的審核；負責有關衛生監督員的管理組織，開展衛生監督稽查等工作。
負責人：俞曉紅
6、法制科
負責本局法制工作的規劃管理和依法行政推進的統籌規劃、綜合協調、督促指導等工作；承辦本局重大行政決策、規範性文件和相關法律文書的合法性審查，負責本局規範性文件的報備、清理和公布；組織有關衛生行政許可、行政處罰聽證會，負責有關行政復議受理和行政訴訟應訴工作；配合有關科室開展法制宣傳與教育等工作。
負責人：殷 浩
7、黨群工作科
負責加強黨的基層組織建設，調整和配備基層領導班子，承擔黨委辦公事務、紀檢監察、宣傳、精神文明建設、信訪、工會、***青團、婦女、離休幹部、統戰、保密、民兵等工作。
負責人：袁 健
8、人力資源科
負責制定本區衛生人才發展規劃，並組織實施；指導、組織開展衛生專業技術職務聘任和任職資格認證有關工作；負責本局系統人員編制、勞動工資、人事檔案、退休幹部的管理等工作。
負責人：陳婷婷
9、區愛國衛生運動委員會辦公室
負責制定全區愛國衛生、健康城區建設規劃和年度工作計劃，並協調區愛衛會成員單位抓好組織落實；負責本區血防鞏固監測及全區衛生創建、達標考核鑒定；組織有關部門開展除四害監督執法檢查。
負責人：馬曉燕
10、區初級衛生保健委員會辦公室（區合作醫療管理委員會辦公室）
負責本區初級衛生保健、農村衛生發展規劃和年度計劃制定，承擔全區農村初級衛生保健具體工作；負責本區農村合作醫療規劃、政策的制定，以及農村合作醫療、農村大病醫療保險組織實施和綜合管理；負責本區村衛生室和鄉村醫生管理等工作。
負責人：湯偉萍