初創時期（1978—1979）
1978年，二醫大黨委討論“計劃任務書”確定“二醫附屬寶鋼醫院”，人員編制為1：1.60。承擔教學醫院、地區三級醫院和寶鋼總廠職工的醫療任務。床位由寶鋼總廠確定為350張，征地40畝，在編職工560人，擬定500至600張床的擴初計劃方案。
開業時期（1980—1982）
1980年1月16日，上海市衛生局正式命名“二醫大附屬寶鋼醫院”。
1980年2月26日，寶鋼醫院正式開張。臨時醫院設在寶鋼8村101號，設有內、外、婦、兒、五官、眼、口腔、皮膚等8個科室，床位50張。
1982年3月，臨時醫院搬遷到新病房大樓，病房大樓正式啟用，床位設置200張。
創業階段（1983—2014）
1982年—1983年，完成第壹期工程，包括：外科大樓、手術樓、門診樓、傳染科門診樓。總建築面積25600平方米，床位增至300張。綠化場地6000余平方米。
1984年4月，寶鋼醫院第二期工程——內科大樓基建計劃任務書上報寶鋼工程指揮部。內科病房樓150張床位，面積為5000平方米，資金350萬元。第二期工程（內科大樓）於1991年11月竣工，1992年啟用。
1985年首次被評為上海市衛生文明單位。截止2009年，我院已獲得6次衛生文明單位稱號。1986年9月 上海市吳淞區紅十字會同意建立上海第二醫科大學附屬寶鋼醫院紅十字會，余棟材同誌任會長。2008年更正冠名為“上海市紅十字第三人民醫院”；2009年榮膺國家“優秀紅十字（會）機構”稱號。
“三級乙等”醫院等級評審
1993年初，,上海市衛生局批復醫院床位由302張增加到502張。同年11月，上海市等級辦對我院進行全面評審，取得優良成績，達到“三級乙等”要求。1994年6月，經市衛生局審核正式認定二醫大附屬寶鋼醫院為“三級乙等”醫院。
愛嬰醫院
1996年被中國愛嬰醫院衛生部正式批準為“愛嬰醫院”。
早期創傷急救中心掛牌
1997年12月，由寶鋼總廠與寶鋼醫院合作建設，寶鋼醫院“創傷急救中心”正式掛牌成立。
國際緊急救援網絡醫院
1999年10月26日，寶鋼醫院被衛生部認定為衛生部國際緊急救援網絡醫院。
四、改革與競爭
2002年，醫院腎內科血透中心經二醫大批準成立，腎內科血液凈化室掛牌。
放射科引進GE Lightspeed OX/I多排螺旋CT和OEC9800數字減影血管造影（DSA）等設備，建立影像診斷和介入治療專業。
2002年10月，二醫大校慶50周年系列活動之壹——影像診斷進展研討會暨寶鋼1.5T雙梯度核磁***振正式開機。
2009年4月，具有世界先進醫療技術水平的64層超高速螺旋CT落戶我院，它是寶山地區首臺64層螺旋CT。
2003年4月，在門診三樓開設出特需門診，旨在讓寶山區居民能就近享受到知名專家優質醫療服務的寶鋼醫院特需門診開始試運轉。並聘請了滬上各大醫院涉及內、外、兒、五官等科的首批15名專家坐鎮。
2003年5月，重組燒傷整形科。醫院燒傷科作為寶山區唯壹壹家集燒傷、整形為壹體的特色科室已有20余年歷史，承擔了多項市科研項目並成為二醫大碩士授予點。新建成的燒傷整形科設有重癥監護室、水療室、功能康復室、燒傷實驗室、獨立燒傷手術室等，新添置了多功能疤痕治療機、超聲吸脂機、激光脫毛機、激光祛斑機等先進設備。
2003年8月，新華醫院X刀放療中心寶鋼分中心正式開張。X刀放療科的設置，填補了寶山區域腫瘤放療的空白，有效地緩解了區域腫瘤病人看病難問題。
榮獲市文明單位稱號
2003年8月，寶鋼醫院榮獲上海市第十壹屆（2001-2002年度）文明單位榮譽稱號。截止2009年，已連續蟬聯4次市文明單位稱號。
成立實驗研究室
2003年8月，醫院實驗研究室成立，面積約300m2。實驗室分為細胞培養室、分子生物學實驗室、離體實驗室及清潔級動物手術室和動物房，可以為細胞和細菌培養、多種動物模型的建立、分子生物學的基本技術、心血管、呼吸、泌尿、消化、內分泌等系統的藥物實驗法等方面提供實驗條件和技術方法、管理的支持。實驗研究室緩解了研究生做實驗研究外借場地的困難，方便了學生和職工科學實驗工作的需求。
五、可持續發展（2005—2009）
援助中西部建設
2003年11月7日，寶鋼醫院與寧夏石嘴山市第二人民醫院在民盟上海市委舉行了《醫療技術支援協作協議》的簽約儀式。
2005年4月15日 ，寶鋼醫院與湖北襄樊市襄陽區人民醫院在樟嶺大樓貴賓室舉行友好合作簽約儀式。
5月19日，龔聖濟院長與寧夏海原縣馬縣長簽署了援建希望小學的意向書，對西部希望小學援助正式開始。9月，由我院出資15萬元建成的寧夏自治區海原縣七百戶希望小學落成。
2007年9月，我院與雲南迪慶州維西傈僳族自治縣葉枝鎮衛生院簽訂了幫扶協議。自此，我院對口幫扶的中西部地區醫院增加到了第三家。
新華醫院集團寶鋼醫院掛牌
2005年3月18日，上海新華醫院集團寶鋼醫院掛牌儀式舉行。此舉為醫院外向型發展，加快醫院醫療水平提高提供了壹個很好的借助平臺，尤其是依托新華醫院兒科學的優勢，將為我院在寶山地區打造兒科品牌學科創造良機。
高壓氧科揭牌
2005年9月，我院高壓氧科正式揭牌，新成立的高壓氧科，擁有國內最先進的三艙七門高氣壓空氣艙群，艙內寬敞、舒適、安全，配有治療艙、過渡艙、搶救艙，可同時容納22人進行治療。
更名為上海交通大學醫學院附屬第三人民醫院
2005年9月，經上海市衛生局核準，上海第二醫科大學附屬寶鋼醫院正式更名為上海交通大學醫學院附屬第三人民醫院。
藥物臨床試驗研究機構資格認定
2005年11月28-29日，國家衛生部、國家食品藥品監督管理局官員及專家壹行6人對我院進行了首次藥物臨床試驗研究機構資格認定現場檢查。
2006年6月，國家衛生部、國家食品藥品監督管理局批準我院機構和腫瘤、感染、普外、婦產四個專業具備進行新藥臨床試驗的資格。
2008年12月29日 我院“十壹五”基建項目——門急診、醫技、病房綜合樓改擴建項目獲上海市發展和改革委員會正式立項。
2009年10月，上海市發改委、上海申康醫院發展中心分別下發《關於同意上海交通大學醫學院附屬第三人民醫院門急診、醫技、病房綜合樓項目可行性研究報告的批復》文件。項目建設占地面積12500平方米，拆除危舊用房11462平方米，總建築面積36100平方米，其中地上建築面積30800平方米，地下建築面積5300平方米。項目總投資估算約21371萬元。
感染科大樓啟用
2006年3月，我院感染科大樓正式全面啟用，包括感染、腸道和發熱門診在內的所有門急診及住院治療全部納入其中。感染科大樓的建造和啟用是醫院加大公***衛生建設，服務地區人民的重要舉措，也是寶山區唯壹壹家收治傳染病病人的中心，該大樓的啟用將進壹步完善區域公***衛生體系，為維護人民健康發揮重要保障作用。
白內障貧困患者免費實施復明手術定點醫院
本著公立醫院公益性特質，2007年4月，我院申報上海市政府實事項目“白內障貧困患者免費實施復明手術”，經上海市衛生局項目專家組評審確認，成為14家定點醫院之壹。
全科醫師培訓基地
2008年，上海市衛生局批準我院為上海市全科醫師培訓基地。
上海市危重新生兒會診搶救中心成立
2008年12月，我院成為首批6個“上海市危重新生兒會診搶救中心”之壹。