國家食品藥品監督管理總局（CFDA）職責很多，食品（保健品），藥品，醫療器械，化妝品等相關的監管工作。關於藥品，又包含藥品上市，藥品監管，上市後再評價等職能。藥品上市，又稱為藥品的註冊。所以這部分職能歸屬於藥品化妝品註冊管理司，下設中藥，化學藥，生物藥等各個職能部門。
藥品化妝品註冊管理司的職能
（壹）組織擬訂藥品化妝品註冊管理制度並監督實施。（二）組織擬訂藥品化妝品相關標準並監督實施。（三）嚴格依照法律法規規定的條件和程序辦理藥品註冊和部分化妝品行政許可、醫療機構配制制劑跨省區調劑審批並承擔相應責任，優化註冊和行政許可管理流程。
（四）組織擬訂藥品化妝品註冊相關技術指導原則。（五）承擔疫苗監管質量管理體系評估、藥品行政保護相關工作。（六）組織實施中藥品種保護制度。（七）承擔處方藥與非處方藥的轉換和註冊，監督實施藥物非臨床研究質量管理規範和藥物臨床試驗質量管理規範，組織擬訂中藥飲片炮制規範。
（八）指導督促藥品化妝品註冊工作中受理、審評、檢驗、檢查、備案等工作。（九）督促下級行政機關嚴格依法實施藥品再註冊以及不改變藥品內在質量的補充申請、醫療機構配制制劑、部分化妝品許可等相關行政許可工作、履行監督管理責任，及時發現、糾正違法和不當行為。
與藥品上市相關的CFDA直屬事業單位1、中國食品藥品檢定研究院（藥品註冊檢驗相關）
職能：1．承擔藥品、醫療器械的註冊審批檢驗及其技術復核工作，承擔保健食品、化妝品審批所需的檢驗檢測工作，負責進口藥品註冊檢驗及其質量標準復核工作。2．承擔藥品、醫療器械、保健食品、化妝品和餐飲服務食品安全相關的監督檢驗、委托檢驗、抽查檢驗以及安全性評價檢驗檢測工作，負責藥品進口口岸檢驗工作。
3．承擔或組織藥品、醫療器械檢驗檢測的復驗及技術檢定工作。4．承擔生物制品批簽發相關工作。5．承擔藥品、醫療器械和餐飲服務食品安全相關標準、技術規範及要求、檢測方法制修訂的技術復核與驗證工作，承擔保健食品、化妝品技術規範、技術要求及檢測方法的制修訂工作。6．承擔藥用輔料、直接接觸藥品的包裝材料及容器的註冊檢驗、監督檢驗、委托檢驗、復驗及技術檢定工作，以及承擔相關國家標準制修訂的技術復核與驗證工作。
7．負責藥品、醫療器械國家標準物質的研究、制備、標定、分發和管理工作。8．負責生產用菌毒種、細胞株的檢定工作，承擔醫用標準菌毒種、細胞株的收集、鑒定、保存、分發和管理工作。9．承擔實驗動物質量檢測和實驗動物保種、育種和供種工作。10．承擔有關藥品、醫療器械和保健食品廣告以及互聯網藥品信息服務的技術監督工作。
11．承擔全國食品藥品監管系統檢驗檢測機構的業務指導、規劃和統計等相關工作，組織開展藥品研究、生產、經營相關單位以及醫療機構中的藥品檢驗檢測機構及人員的業務指導工作。12．組織開展藥品、醫療器械、保健食品、化妝品和餐飲服務食品安全相關標準研究以及安全監測和質量控制新方法、新技術研究。13．承擔國家食品藥品監督管理局科技管理日常工作，承擔保健食品、化妝品和餐飲服務食品安全相關專家委員會的日常工作。14．承擔嚴重藥品不良反應或事件以及醫療器械不良事件原因的實驗研究。 15．組織開展藥品、醫療器械、保健食品、化妝品和餐飲服務食品安全相關檢驗檢測工作的國際交流與合作。
2、藥品審評中心（藥品技術審評，把關工作）
職能：1．負責對申請註冊的藥品進行技術審評，組織開展相關的綜合評審工作。2．參與起草藥品註冊管理相關法律法規和規範性文件，負責制定藥品審評規範並組織實施。3．開展藥品審評相關的理論、技術、發展趨勢及法律問題研究。承擔藥品審評工作相關法律事務。4．組織開展相關業務咨詢服務及學術交流，組織開展藥品審評相關的國際交流與合作。5．指導地方藥品審評相關工作。參與相關藥品註冊核查工作。
3、食品藥品審核查驗中心（藥品註冊現場核查相關工作）
職能：1．組織制定藥品、醫療器械、化妝品審核查驗工作的技術規範和管理制度。參與制定藥品、醫療器械、化妝品相關質量管理規範及指導原則等技術文件。2．組織開展藥品註冊現場核查相關工作。開展藥物研究、藥品生產質量管理規範相關的合規性核查和有因核查。開展醫療器械相關質量管理規範的合規性核查、臨床試驗項目現場核查以及有因核查。組織開展藥品、醫療器械、化妝品質量管理規範相關的飛行檢查。 3．承擔相關國家核查員的聘任、考核、培訓等日常管理工作，指導地方核查員隊伍建設。
4．指導地方藥品、醫療器械、化妝品審核查驗相關工作，開展審核查驗機構能力評價相關工作。5．負責匯總分析全國藥品審核查驗相關信息，開展相關風險評估工作。開展藥品、醫療器械、化妝品審核查驗相關的理論、技術和發展趨勢研究。組織開展相關審核查驗工作的學術交流和技術咨詢。6．組織開展藥品、醫療器械、化妝品相關境外核查工作。承擔審核查驗相關的國際交流與合作工作。
其他相關部門，如行政受理中心，負責受理擬上市藥品的申報材料；藥典委，負責擬上市藥品的名稱工作。
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