業界對社區醫生工作站系統的認識近來趨於壹致，認為壹套成熟的完善的社區全科醫生工作站軟件產品應該具備如下基本功能：
壹、數字接診：可以通過刷卡或輸入單號等多種方式自動獲取就診病人的基本資料。
二、電子病歷：包括電子病歷的書寫、處方及驗單的錄入，病歷書寫和處方下達支持多種輸入方法，有比較完善的中西醫主訴、體征等公***常用詞庫；支持建立個人常用詞庫，支持自定義電子病歷、處方公***模板和具有個性化功能的個人模板。在填寫電子病歷時，系統提供對過敏藥物藥品的提醒功能，方便醫生在開處方時做出註意事項，並根據病人的過敏病史限制處方用藥。
三、支持智能診斷和輔助分析，可以自動從居民健康檔案和當前電子病歷中采取相關數據並進行輔助分析，為醫生提供診斷思路。能夠提供多種輸入方式：ICD碼輸入、ICPC碼輸入、中文疾病名輸入及模糊匹配選擇輸入、專科常見疾病列表（包括中醫診斷）選擇輸入等；提供診斷描述的輸入表，提供診斷的主次分級，用於疾病統計分析。系統判斷診斷為傳染病時自動生成傳染病報告，報本院相關部門。中醫診療：有中醫征候、中醫處方、中醫診斷、代表方劑的模板；有中藥、中醫制劑及中成藥的用法、配伍禁忌校驗。
四、網絡傳輸：醫生利用工作站系統提供的生成器直接下達電子處方、化驗單、檢查單、治療單、門診手術預約單，即時顯示藥品詳細信息及收費標準。處置單（處方、各類申請單等）支持網絡傳輸，到達收費處以及相關部門。
五、信息查詢：提供病案和處方的信息查詢、藥品缺藥、醫療違規警告、用藥咨詢、配伍禁忌的校驗、劑量超量提示、適應各種公費醫療和醫保政策、處方權限制等。具有專門復診病歷錄入與管理功能，關聯病患個人病歷的信息，支持既往病歷信息的***享與復用。
六、輔助檢查檢驗結果文字報告查詢：提供各醫技功能模塊的接口件，並與各醫技模塊連接，可以隨時查詢病人的檢查結果，並提供正常參考值對照。
七、門診工作管理：醫生可管理當前候診病人和已就診病人，可設置當天最大門診量，並可在醫生工作站上做到自動刷新醫生排班信息，生成醫生個人工作日誌，門診日誌，肺結核、性病、法定傳染病的登記本，20歲首診測血壓的記錄本。
八、健康檔案維護管理：以電子健康檔案為基礎，在接診的同時系統可以自動調出該病人的健康檔案，並提示新建或更新檔案；診療結束後智能歸檔。
九、接口設計：可與第三方軟件做到無縫連接。提供與檢驗設備的接口程序。
十、急診急救：社區醫生工作站系統還應該隨機提供急診等特殊緊急情況下的處理方案。
十壹、退藥管理。
十二、統計分析：提供病歷查詢，疾病統計分析等，可按多個關鍵詞檢索病歷，並按條件進行統計分析。
目前，已經有很多的公司如濟南大成華博生物技術有限公司等面向市場提供社區醫生工作站系統的商品軟件，以滿足社區衛生服務機構數字化建設和社區醫生更好地履行職責和學習培訓的需要,特別是基於全科醫學的診療系統的社區醫生工作站概念的提出是對全科醫生工作站的進壹步的發展。