已要求各醫療機構切實保障急診綠色通道暢通，保障發熱門診、血液透析、重癥、產科、兒科、放化療等重點科室服務和住院患者接診。為方便市民就醫咨詢，當地媒體“上海發布”、“健康上海”及微信官方賬號每日整理發布各大醫療機構就醫咨詢停止情況，供廣大市民參考。“隨申辦”還推出了“關於各大醫院部分科室停辦的查詢”服務。壹般情況下，建議在封閉控制區內解決問題。如有特殊情況，社區可協助閉環轉運至所需醫療機構。
在大量醫護人員忙於防疫的同時，壹些特殊疾病的醫療卻出現了短缺。中國非公立醫療機構協會常務副會長兼秘書長郝德明接到上海浦東新區疫情防控辦公室的電話，對方提出急需招募血液透析工作誌願者。隨著新冠肺炎疫情的不斷變化，浦東新區血液透析患者急劇增加，血液透析醫療資源日益匱乏。有針對性地做好高血壓、糖尿病等慢性病老人、兒童、產檢的後續服務。社區衛生服務中心的家庭醫生要主動對接，同時要對接上級醫院的資源，主動關心加強管理，主動介入。
在新冠肺炎疫情的特殊時期，醫院的醫護人員基本都是隨時待命的。當有生命危險的病人入院時，即使衛生編碼為黃色或者沒有核酸陰性證明，仍然需要優先搶救。