約亞西姆·瓊塔本人僥幸躲過對教團的毀滅行動，自己身份也暫未暴露。但在教團已經不復存在，且各個勢力均在繼續追查的情況下，失去教團後盾的約亞西姆自覺可能落網。於是為了躲過通緝，他利用過去掌握的克洛斯貝爾自治州議會議長——哈爾特曼與教團有染、行為不端的把柄，逼迫哈爾特曼協助他在克洛斯貝爾潛伏下來。哈爾特曼被迫就範。借此機會，約亞西姆與在哈爾特曼保護傘下的克洛斯貝爾黑社會組織魯巴徹商會也搭上了關系，利用其幫助開展自己的活動。同時，約亞西姆憑借自己的學識和在醫學界的影響力，順利在聖烏爾斯拉醫科大學獲得了職位，為自己披上了合法身份的外衣。
從此以後，依靠“真知”帶來的超人的體力，約亞西姆白天在醫科大學工作，晚上則在太陽堡壘建立其自己的實驗室，依靠過去積累下來的實驗資料和數據，繼續進行“真知”的研發、改進和生產。
魯巴徹商會知曉約亞西姆的真實身份，但並不了解約亞西姆從事過和正在從事的活動的詳情，對於“真之睿智”的實際效用更是幾乎壹無所知。這也導致了他們最後輕易被約亞西姆欺騙和綁上毀滅的戰車。
太陽堡壘除了作為約亞西姆的地下藥物工廠，其最底層還有古代遺留下的祭壇，約亞西姆在這裏供奉據說已經存在並且沈睡了500年的神秘女孩——琪雅，約阿希姆對琪雅正式稱呼為聖子，琪雅的真實身份在零軌中並未揭示，而在碧軌中公布。 約亞西姆·瓊塔工於心計、城府極深。在初登場時，給人壹種為人風趣幽默的感覺，並且和自己的實習生利頓調侃（稱自己是M而不是S……）。在第三章翹班釣魚事件中，似乎又是壹種為人單純、心地善良的感覺。故而從未有人懷疑他。
約亞西姆的偽裝能力十分高超。羅伊德等人救出琪雅後，為了確診琪雅失憶癥狀的原因，帶琪雅去聖烏爾斯拉醫科大學找約亞西姆就診。多年來供奉沈睡中琪雅的約亞西姆，自然壹眼就認出了琪雅的真實身份。雖然他此時正因為琪雅的意外失蹤而焦急萬分，並且渴望更早的將其奪回，但是約亞西姆在整個診斷期間非常正常，完全沒有表露出任何異狀，甚至於琪雅表示不想住院時，也並未強留。
更有甚者，在第四章悄然襲來的睿智期間，當特別任務支援科帶著收繳來的“真之睿智”樣品，找到他尋求藥品成分鑒定的時候。約亞西姆面對自己制造的犯罪工具已經落入警方手中，教團可能被重新納入偵查視線，自己的身份也可能隨之暴露這壹重大危險，依然鎮定自若。不僅非常正常地與羅伊德等人進行了案情討論，還主動在言語間語焉不詳地提到了D∴G教團和教團實驗的存在（當時特別任務支援科除了賽爾蓋科長和緹歐之外，並沒有人知道過去的教團事件），似乎在積極地引導警方向正確的方向偵破。對於羅伊德等人提出鑒定藥物成分的請求，約亞西姆更是爽快的答應了下來。
壹系列的自我偽裝和反偵察，使得所有參與調查的各方，壹直沒有對約亞西姆產生懷疑。 羅伊德壹行人大鬧地下拍賣會，使得魯巴徹商會顏面盡失，為了挽回地位，同時防禦競爭對手——從卡爾瓦德***和國滲透來的黑社會組織黑月，魯巴徹商會的頭目馬爾克尼會長不顧副手加爾西亞的反對，決定聽從約亞西姆的鼓動，動用“真知”。魯巴徹商會開始讓自己的成員服用“真知”以強化身體能力，並且開始在黑市上暗中販賣以獲利。
流通到市面上的真知立刻引發了各種異常案例，而服用了“真知”的魯巴徹成員也在與黑月的對抗行動中行為反常。特別任務支援科在日常行動中得到了相關線索，對此產生了懷疑，並順藤摸瓜，收繳到了“真知”的樣本。
如前所述，調查各方均未對約亞西姆有過任何懷疑，因此羅伊德等人想到找約亞西姆進行咨詢，並請求其進行藥物成分鑒定。約亞西姆依然以毫不引人懷疑的態度接受了請求。但是暗中，約亞西姆似乎判斷計劃即將敗露，於是立即開始著手準備襲擊行動進行攤牌。
約亞西姆有能力對服用過“真知”的人，進行精神操縱。之前約亞西姆鼓動魯巴徹成員服用“真知”便是為了這壹目的，此時他對魯巴徹的成員發動了精神控制，通過讓受控者強迫未服藥者也服藥，最終監禁了馬爾科尼會長，並操縱了魯巴徹的全員，控制他們秘密離開市區，做好攻擊準備。為了加強戰力，他又騙以前通過哈爾特曼議長認識的警備隊司令，讓貝爾加德門方面的警備隊員全體服用了“真知”。為了爭取時間完成準備，他故意向警方發出了空港可能遭到炸彈襲擊的匿名假警報，將警方的人手牽制過去，還壹再拖延與特別任務支援科的聯絡。待到準備就緒後，他便首先操縱魯巴徹成員，對聖烏爾斯拉醫院和烏爾斯拉間道的公交車發動了襲擊，切斷了聖烏爾斯拉醫院與外界的壹切聯系。
正在此時，壹直等不來約亞西姆對藥物鑒定結果報告的特別任務支援科，決定親自去聖烏爾斯拉醫院跑壹趟。但是到了南出市口，卻發現公交車已經很反常的延誤了很久。此時警察局搜查壹科的達德利搜查官聯絡羅伊德，當得知羅伊德請的鑒定醫生就是約亞西姆時很是訝異，並告訴羅伊德，約亞西姆便是刺殺市長未遂的前市長秘書阿奈斯特·萊茲多年來的主治醫生。阿奈斯特被捕後突然陷入莫名的精神錯亂，也是請約亞西姆來協助審訊才順利完成了提審。由於在刺殺市長事件中，阿奈斯特表現出異於常人的行動力，和克洛斯貝爾各處由於“真知”泛濫而出現的各種異常狀況類似，再加上這次聯絡無故拖延和公交車的反常延誤，雙方都開始懷疑約亞西姆。
特別任務支援科立即與聖烏爾斯拉醫院進行通訊聯絡，但已經無法打通。覺得事態緊急，羅伊德等人決定步行前往調查。在路上發現了被遺棄的公交車之後，他們在醫院門口遭到了魯巴徹成員和魔獸的襲擊。在“銀”的中途加入下，羅伊德等人清除了占領醫院的黑手黨和魔獸，並在約亞西姆的辦公室，與不知何時越獄的阿奈斯特交手。阿奈斯特留下意味深長的話語後逃離。通過對約亞西姆留下的資料的調查，以及突然出現在房間裏的玲的指引，羅伊德等人完成了有關約亞西姆身份的最後拼圖。
將醫院的調查工作交給隨後趕來的索尼婭司令和唐古拉姆門警備隊之後，羅伊德等人乘車返回市區。但是，正當他們在支援科大樓，與塞爾蓋科長和達德利警官商談時，約亞西姆操縱貝爾加德門警備隊，對市區各重要設施發動了襲擊。被迫帶著琪雅逃亡的羅伊德等人，得到了IBC迪塔·庫羅伊斯總裁和其女兒瑪麗亞貝爾·庫羅伊斯的庇護，並在隨後趕來的亞裏歐斯等援軍幫助下穩定了局勢。
隨後，得知了約亞西姆藏身於太陽堡壘的羅伊德等人，趕往太陽堡壘與艾絲蒂爾和約修亞會合，執行抓捕行動。在壹行人突破重重阻力來到地底湖時，約亞西姆利用“魔眼”（即空之軌跡裏蓋魯格·懷斯曼經常使用的空間禁錮咒術）禁錮住所有人，但是羅伊德巧妙地破解了魔法，惱羞成怒的約亞西姆吞服下壹整瓶真知完成品，變異為強大的魔人。魔人化的約亞西姆不但傷害力驚人，而且修復能力極強，最終在殲滅天使·玲的幫助下，羅伊德等徹底打敗了約亞西姆。