商品檢驗制度是指商品檢驗機構對進出口商品的質量、規格、重量、數量、包裝、殘損等依法進行檢驗，出具檢驗證書。此外，商檢機構還負責對出口食品的衛生檢疫和向非協議國家出口動物產品的病蟲害檢疫，對進口貨物的環保狀況進行鑒定。國家出入境檢驗疫局是我國負責檢驗進出口商品的主管機構，由該機構制定、調整並發布的《出入境檢驗檢疫機構實施檢驗檢疫的進出境商品目錄》，調整後的《檢驗檢疫商品目錄》涉及編碼商品4113個。
我國商品檢驗的種類分為4種，即法定檢驗、合同檢驗、公證鑒定和委托檢驗。法定檢驗是指根據國家規定，對進出口商品實施強制性的檢驗，凡列入《出入境檢驗檢疫機構實施檢驗檢疫的進出境商品目錄》的進出口商品均屬法定檢驗商品；進口時，海關憑商檢機關拓報關單上加蓋的印章放行。出口時，報驗手續在向海關申報之前進行。海關憑商檢機構的檢驗證書、放行單，或憑其在報關單上加蓋的印章驗放。 為了防止動物傳染病、寄生蟲病和植物危險性病、蟲、雜草及其他有害生物的傳播和蔓延，保障我國農、林、牧、漁業生產和人體健康，維護我國的對外信譽，國家規定對進出境的動植物及其產品實施檢疫。凡屬應當施行動植物檢疫的進出境貨物，無論以何種貿易方式進出境，都應當在報關前報請入境或出境口岸的動植物檢疫機構實施檢疫，由動、植物檢疫機構發給《檢疫放行通知單》或在貨運單據上加蓋檢疫放行章後，再向海關申報。
應實施動樾持檢疫的範圍包括進出境的動植物、動植物產品和其他檢疫物，裝載動植物、動植物產品和其他檢疫物的容器、包裝物以及來自動植物檢疫區的運輸工具。例如：
1、動物：家畜、家禽、獸、蛇、魚、蝦、蟹、貝、蠶、蜂等。
2、動物產品：生皮張、毛類、肉類、臟器、油脂、蛋類、血液、精液、胚胎、骨、蹄、角等。
3、植物：載培植物、野生植物及其種籽、種苗、繁殖材料等。
4、植物產品：糧食、稻類、棉花、油類、麻類、煙草、籽仁、幹果、鮮果、蔬菜、生藥村、木材、飼料等。 藥品檢驗是國家為了防止假藥、劣藥非法流入國內而制定的對進口藥品（包括藥材）實行檢驗的制度。我國對進口藥品實行註冊制度，即進口藥品，須取得衛生部核發的《進口藥品註冊證》或《壹次性進口藥口批件》，經營進口藥品的外貿企業，須具有衛生主管部門核發的《藥品經營企業許可證》。藥品到達口岸後，有關單位應及時向口岸藥檢所報檢，海關憑藥檢所在進口貨和報關單上加蓋的已接受報檢的印章放行。
對進口血液制品，國家規定從嚴掌握和限制，確屬臨床醫療需要進口的，進口單位慶事先報經衛生部批準。進口時，由口岸藥檢所審查批準文件，按規定程序實施檢驗後放行。
對進出口精神藥物、麻醉藥物，按照國務院發布的《精神藥品管理辦法》和《麻醉藥品管理辦法》的規定執行。精神藥物由外經貿部指定的單位按照國家有關外貿規定辦理，麻醉藥品由中國醫藥保健品進出口總公司及地方分公司或由衛生部、外經貿部指定的單位辦理。進出口時，應報衛生部審查批準，發給《精神藥品進（出）口準許證》、《麻醉藥品進出口準許可證》，海關憑準許可證驗放。 食品檢驗指的是按照我國衛生標準和要求對進口食品、食品原料、食品容器、食品添加劑、包裝材料等進行檢驗的制度。
進口時，由國境衛生監督機構進行衛生監督、檢驗。海關憑國境食品衛生監督機構出具的證書放行。出口食品，由國家進出口商品檢驗部門進行衛生監督、檢驗，海關憑上述機構的檢驗證書放行。 瀕危物種管理是指瀕於滅絕和有滅絕危險的野生動物和植物，範圍包括列入《瀕危野生動樾的種國際貿易公約》附錄1和附錄2文件中的全部物種。長期以來，人類在獲得發展的同時，由於各種原因造成自然資源面臨枯竭的危險，許多野生動植物滅絕的速度加快，成為珍貴稀有野生動植物。壹旦自然生態失去平衡，危及的將是人類自身。為此，國際上要求保護瀕危物種的呼聲越來越高，管理上越來越嚴。在我國，有識之士不斷呼籲制止濫捕濫殺珍貴、瀕危野生動物的行為。我國現已加入了《瀕危野生動植物種國際貿易公約》，並制定了《中華人民***和國野生動物保護法》。林業部也下發了《關於保護珍貴樹種的通知》等許多法規。
此外，我國還制定了旨在與自然生態環境保持和諧的可持續發展戰略。根據國家規定，凡進出口中國已加入的國際公約所限制的進出口野生動物或者其產品的，出口國家重點保護野生動物或者其產品的，必須經國務院野生動物行政主管部門或者國務院批準，並取得國家瀕危物種進出口管理機構核發的允許進出口證明書，滌馮憑允許進出口證明書查驗放行。凡出口含珍貴稀有野生壢植物中成藥，出口痢，憑國家瀕危物種進出口管理辦公室簽發的允許出口證明書向海關報關。 文物是壹個國家的歷史文化遺產，有的文物甚至價值墨守成規城。因此，許多國家都立法加以保護，以防止文物的流失。
《中華人民***和國文物保護法》規定，凡有重要歷史、藝術、科學價值的文物，除經國務院批準運往國外展覽以外，壹律禁止出境。對暫時進出境文物，如經國家批準的對外文化交流、出口展覽、合作研究等項目或其他需由甸駐外機構人員、出訪人員攜帶、托運或郵寄的暫時出境文物，在出境前，由當地文物出境鑒定站根據批準文件和文物清單、照片，查驗無誤後簽發出境證明；復帶文物進境時，須根據清單、照片進行復驗，海關憑出境證明按暫時出境貨物予以驗放。對出口文物或個人攜帶文物出境，必須在報關前，和國家文化行政管理部門指定的省、自治區、直轄市文化行政管理部門鑒定，海關憑該部門蓋的火漆標誌或文物出口證明放行。國家對需要辦理鑒定的出境文物的品種作出了規定，在壹些地方還成立了文物鑒定站負責此項工具境外人員托運、攜帶文物出境的，還應在報關時交驗用外匯購買的文物銷售發票。 根據國家有關金銀管理條例的規定，出口金銀制品，必須向海關遞交中國人民銀行制發的《金銀制品出口準許證》，海關憑準許證驗放。
為加工出口成品需從國外進口的金銀原料，應當在進口後持進口報關單到中國人民銀行辦理登記手續，以便出口時審查發證。
根據國家有關對攜帶外匯進出境管理的規定，進出境人員攜帶外匯出入境超過規定數額，應視情況向銀行申請“攜帶證”或向當地外匯管理局申請核準，銀行憑核準文件簽發“攜帶證”，海關憑“攜帶證”放行。 進口廢物，俗稱“洋垃圾”，是指在生產建設、日常生活和其他活動中產生的汙染環境的有害物質、廢棄物質，包括液態廢物和氣態廢物。國際上列入有害廢物管理的***有23項。
據估計，全球每年產生垃圾100億噸，有害廢物3億多噸，這些垃圾和廢物絕大部分得不到有效處理，由此出現有害廢物和垃圾的跨國間轉移。壹些發達國家將大量工業和生產垃圾，特別是有害廢物以各種名義，通過各種渠道向發展中國家轉移，我國也成為轉移的受害對象。
我國於1990年加入了聯合國環境計劃署通過的《控制危險廢物越境轉移及其處置的巴塞爾公約》。國家環保局、外經貿部、海關總署、國家工商局、商檢疫站局聯合頒布了《廢物進口環境保護管理暫行規定》並於1996年4月1日起施行。
《暫行規定》禁止進出境外廢物在境內傾倒、堆放、處置。限制進口可以用作原料的廢物，對列入國家限制進口可用作原料的九大類廢物的進口，須經國家環保局審批，其他廢物嚴禁進口。
《暫行規定》還對進口可用作原料的廢物的申請和審批手續作了嚴格規定，實行環境保護風險責任，海關憑國家環保局簽發的《進口廢物批準證書》和口岸所在地商檢機構的檢驗合格證明驗放。對檢驗不合格的廢物，海關依法責令退運和任罰款處理。對違反規定北朝將境外廢物進境傾倒、堆放、處置，或擅自進口廢物用作原料的行為，依法嚴肅處理，構成犯罪的，將追究刑事責任。 知識產權保護是國際社會普遍關註的壹個重要問題，面對與國際貿易有關的知識產權侵權在全球範圍內的不斷蔓延，許多國家海關紛紛采取保護措施，有關國際組織也在積極行動。1985 年世界海關組織制定了《關於授權海關實施商標和版權保護的國內立法的示範法》。關稅與貿易總協協定烏拉圭回合談判最終於1994年形成了《與貿易有關的知識產權協議》（簡稱TRIPS）。1995年國務院第179號令發布了《中華人民***和國知識產權海關保護條例》，於當年10月1日起實施。該條例對知識產權邊境保護的宗旨、範圍、海關職權及義務、知識產權備案、保護申請、擔保、調查和處理、8法律責任等問題作出了明確規定。
其內容主要包括：1、保護範圍：受中國法律保護的，並與進出境貨物有關的商標權、著作權、專利權；2、法律依據：凡受中國法律、行政法規保護的知識產權侵權貨物禁止進出口，表明了中國政府對保護知識產權所持的基本立場；3、保護備案；知識產權權利人需要海關對其知識產權實施保護，應當向海關總署備案；4、保護申請：海關除對侵權貨物可以扣留外，原則上應由知識產權權利人請示海關采取保護行動；5、擔保：申請人請求海關扣卵巢進出境貨物時，應當提供與進出口貨物到岸或離岸價格等值的擔保金，以防因錯扣而引起的賠償損失要求及承擔相關費用；6、處罰：海關可沒收侵權貨物並可同時處以罰款。