被1營養物質汙染的高密度養殖，肯定需要大量的餌料，但根據歐洲對網箱養殖的三文魚的研究，只有20%左右的餌料得到有效利用，其余80%基本以殘留餌料、碎屑、排泄物等汙染物的形式排放到其水環境中。它們對水中氮和磷的含量有很大的影響。
2毒品汙染？為了預防水生動物的疾病，水產養殖中經常使用殺菌劑等藥物，也大量使用除草劑等藥物控制水生植物。為了減少有害生物對水產品產量的影響，將增加農藥和滅螺劑的用量。農民的目的是減少對環境的破壞，但大量藥物的使用讓現實與其初衷背道而馳。這些藥物有的會直接流失到環境中，抗生素的殘留會大大削弱養殖水體的降解能力，對水生生態系統造成壹定的破壞，最終造成短期的環境退化。
沈積物富集汙染研究表明，開放水體沈積物汙染較輕，但開放水體沈積物中含有大量C、N、p，根據黑龍潭水庫網箱養魚對水環境影響的調查，壹年內庫底沈積的糞便和殘餌量達1625噸，構成內負荷的二次汙染源，造成網箱區水體富營養化。
4方案1重視殘餌的回收，再通過吸泥、拋石子、撒生石灰等改變底料。
2.在養殖的閑置期，清除多余的淤泥，保持池底幹燥，最大限度地消除殘餌長期堆積造成的富營養化。另外，用魚餵水可以調節浮遊生物的結構，降解氨氮。
3.使用生態營養飼料。為了提高蛋白質的利用率，可以在飼料組合物中添加易消化的碳水化合物；為了減少飼料中氮的排泄，飼料中的能值應與蛋白質含量最佳匹配。適量添加植酸酶可以促進磷的吸收。另外，合理的飼養標準也很重要，可以減少廢物的產生。
4合理用藥。用藥時壹定要考慮其對養殖水體的影響，所以要減少用藥量，盡可能使用天然藥物或綠色水產藥物，以維持養殖水體的生態平衡。