衛生行政部門，壹般是指各級政府負責衛生計生行政工作的部門，比如我們經常提到的國家衛生計生委和各省、自治區衛生計生委，各市、縣衛生計生局。
衛生行政部門，主要負責衛生政策、環境工作，具體執法、業務工作由下屬事業單位實施，下屬事業單位包括行政執法的衛生監督局（所），負責傳染病防控的慢性病防治中心（原名衛生防疫站），負責婦幼衛生的婦幼保健院，以及各級醫院、鄉鎮衛生院等和鄉鎮衛生院等。
法律依據
《中華人民***和國食品安全法》第壹章 總 則
第六條 縣級以上地方人民政府負責本行政區域內的食品安全監督管理工作，統壹領導、組織、協調本行政區域內的食品安全監督管理工作和食品安全工作。應對食品安全突發事件，建立健全食品安全監督管理全程工作機制和信息**** 享機制。
縣級以上地方人民政府依照本法和國務院的規定，確定本級食品藥品監督管理、衛生行政等有關部門的職責。有關部門負責各自職責範圍內的食品安全監督管理工作。
縣級人民政府食品藥品監督管理部門可以在鄉鎮或者特定區域設立派出機構。
《中華人民共和國食品安全法實施條例》第二章
第九條：食品安全風險監測工作由省級以上人民政府衛生行政部門會同同級質量監督、工商行政管理、食品藥品監督管理部門確定的技術機構承擔。
承擔食品安全風險監測工作的技術機構應當按照食品安全風險監測計劃和監測方案開展監測工作，確保監測數據真實、準確，並按照食品安全風險監測計劃和監測方案的要求，將監測數據和分析結果報省級以上人民政府衛生行政部門和承擔監測任務的部門。
食品安全風險監測人員采集樣品、收集相關數據，可以進入相關食用農產品種植養殖、食品生產、食品流通或者餐飲服務場所。采集樣品，應當按照市場價格支付報酬。
第十條 食品安全風險監測分析結果顯示可能存在食品安全隱患的，省、自治區、直轄市人民政府衛生行政部門應當及時將有關情況通報本行政區域內的市、縣級人民政府及其衛生行政部門。
第十壹條 國務院衛生行政部門應當收集、匯總食品安全風險監測數據和分析結果，並向國務院質量監督、工商行政管理和食品藥品監督管理部門以及國務院商務、工業和信息化主管部門通報。