避免陽光直射。可以用黑屏把水管包起來。
2.化學方法:
(1)硫酸銅消除法:在進水口處放壹些硫酸銅，每立方米使用0.7g硫酸銅；(以硫酸銅為例，合適的投加量為:藍藻和矽藻0.12 ~ 1.00mg/L；綠藻0.10 ~ 1.50毫克/升，其中球菌2.5 ~ 3.0毫克/升；金藻0.05 ~ 0.50毫克/升，其中木瓜2.50毫克/升。)硫酸銅和硫酸亞鐵可用於苔蘚，濃度分別約為1ppm和1-2ppm。藍礬消滅法:每畝水用藍礬2斤~ 3斤，配水20斤。
(2)使用苔蘚去除劑(50毫克/升新潔爾滅除藻劑)。
(3)使用稀酸(稀鹽酸、醋酸等。)來回流動以便移動。將自來水清洗幹凈，然後用食用堿水中和，最後將自來水清洗幹凈，直至PH試紙顯示中性(PH7.5-8.0)。
(4)可用漂白粉和生石灰清除。濃度分別約為10ppm和60-100ppm。平時定時使用石灰水(10% ~ 20%石灰水由新鮮石灰制成)。石灰水的制備方法是:1公斤生石灰，4 ~ 9公斤水。先把生石灰放在桶裏，加壹點水溶解，再加足夠的水。現在用的是石灰水，放太久就失效了)。沖洗可以防止苔蘚的生長。
(5)慎用2%比例的戊二醛。基本方法:添加量要由少到多逐漸增加。每10升水，可加入10 ml至2%，開始控制在5 ~ 6 ml為宜，第二天3 ~ 4 ml，第三天1/3(如有問題可減少)。三天後藻類會有明顯的變化，水可能會有輕微的混合。
(6)用A、B兩種試劑配制復合除藻劑；將高錳酸鉀粉碎，制成水溶液-試劑A；按照0.03克∶0.5毫升∶100毫升的比例配制酸溶性氯化亞銅、37%濃鹽酸和水，分別將氯化鋁和氯化鈉配制成水溶液，然後用酸溶性氯化亞銅、氯化鋁水溶液和氯化鈉水溶液配制試劑B；a、B試劑分開存放；使用時，將A、B兩種試劑現場混合，形成復合除藻劑。
(7)草木灰水:草木灰水是在10kg水中加入2-3kg新鮮草木灰(蠶豆稈、油菜稈、向日葵稈燃燒後的殘渣)，加熱煮沸(或用熱水浸泡3晝夜)，待草木灰水澄清後使用。每畝水使用50到109公斤草木灰。