甲類藥品按照100%的報銷比例報銷。乙類要自己出壹部分費用，報銷壹部分。具體報銷比例根據各地政策和具體藥物不同。
醫保目錄是根據國家基本藥物目錄選擇的，甲、乙類是根據療效價格比確定的，也就是說療效確切、費用低的都納入甲類，不需要自付，而乙類基本都有自付比例，同壹種藥不同省市自付比例不同。
如宜賓市乙類藥品報銷金額高達100%。宜賓市人社局規定，全市範圍內對參保居民實行基本藥物零差率銷售的鄉鎮中心醫院和衛生院(社區衛生服務中心)使用基本藥物目錄內的藥品，其中屬於乙類藥品的參照甲類藥品不設個人自付比例。
此外，各地勞動和社會保障局有權調整醫保乙類品種，轉入轉出總額控制在品種數的15%以內，各地無權調整醫保甲類品種。
擴展數據
2月23日，人力資源和社會保障部公布了基本醫療保險、工傷保險和生育保險國家藥品目錄(2017版)(以下簡稱“新藥目錄”)，並發布了相關通知。新版藥品目錄由仿制藥、西藥、中成藥和中藥飲片四部分組成，其中西藥和中成藥共包含2535個藥品，較2009版增加339個，增幅約為15.4%。
人力資源和社會保障部要求，各省(區、市)社會保險主管部門不得對新版藥品目錄中的甲類藥品進行調整，對乙類藥品的調整應嚴格按照現行法律法規和文件執行。
人力資源和社會保障部要求，各省(區、市)要在7月31，2017前公布基本醫療保險、工傷保險、生育保險本地藥品目錄。調整後的數量(包括調入、調出和限定支付範圍調整)不得超過乙類藥品全國數量的15%。各省(區、市)乙類藥品的調整須報人力資源和社會保障部備案。
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