2013年，三明學院* * *有8個項目獲得省科技廳批準，* * *獲得資助96.5萬元。其中，福建省自然科學基金3項(654.38+0.3萬元)，福建省重點項目3項(30萬元)，福建省產學研合作重大科技項目654.38+0項(50萬元)，福建省軟科學項目654.38+0項(3.5萬元)。省社科規劃項目立項7項，總經費9.5萬元。國家自然科學基金資助項目2項，資助金額50萬元。
在福建省教育評估研究中心公布的2012年度福建省普通高等學校(普通本科高校)內涵建設主要評估指標中，學校獲得“科研創新平臺”第壹名；“年度科研成果轉化(萬元)”位居第二；“年度省級以上科研成果獎”、“年度科研成果轉化(項)”排名第三；“年度橫向科研經費”和“年度科研經費”位列第四。2015年6月官網顯示，校級科研院所12個。省級科研團隊1個，省級重點實驗室2個，福建高校服務海峽西岸經濟區建設重點項目8個，省級創新平臺12個，省級“2011協同創新中心”1個。
省級工程技術研究中心:福建固定床清潔煤氣化工程技術研究中心、藥用植物開發利用工程研究中心、三明機械CAD工程研究中心。
省重點實驗室:福建省材料工程與結構加固重點實驗室
省級人文社會科學研究基地:三明大學生態文化研究中心。
研究機構:福建三明汽車工程研究所、閩臺林業研究所、客家文化研究所、計算機應用技術研究所、林產化學與塗料研究所、應用生物技術研究所、資源開發與規劃研究所、CAD/CAM技術研究所、生態文化與鄉土文化研究所、應用化學與化工研究所。
其他科研機構還有復旦大學-三明大學天然藥物工程研究中心、福建中草藥草珊瑚標準化種植技術示範基地、R&D及海峽兩岸動漫遊制作中心等。《三明學院學報》創刊於1984，2010由季刊改為雙月刊。被評為“全國優秀社科期刊”、“全國地方高校優秀期刊”。被中國期刊網、中國學術期刊(光盤版)、中國學術期刊綜合評價數據庫、萬芳數據-數字期刊群等數據庫和檢索期刊收錄。截至2011、12、31，紙質文獻785800份，電子書5675438+0000份，報刊1733份。積累和保存了1.1.5萬冊具有較高歷史參考價值的古籍，如明末的《玉海》、清代的《四庫北要》、民國的萬友圖書館等。