與西藥相比，中藥的配伍使用是中醫理論中的在大特色，早在兩千多年前，我國的藥學專著《神農本草經》裏就記載了中藥的配伍、服用等基本原則。
配伍的概念
根據病情的不同需要和藥物的不同特點，有選擇地將兩種以上的中藥配合在壹起使用，叫做配伍。在遠古時期，治療疾病壹般都是采用單味藥物的形式，後來由於藥物品種日趨增多、對藥性特點不斷明確、對疾病的認識逐漸深化以及疾病的復雜等原因，中藥也就由簡到繁出現了多種藥物配合應用的方法，並逐步積累了配伍用藥的規律。這樣既照顧到了復雜病情，又增進了療效，同時也減少了單味藥物的毒副作用。因此，中藥常常配伍使用。
配伍的原因
病情需要
人們所患的各種疾病都是由多種病邪及病因所致，而且患病以後的表現也各不相同，常常是許多病癥綜合在壹起，如感冒時除了有怕冷、發燒外，還有頭痛、嗓子痛、流鼻涕等癥狀；患肺結核時除了有咳嗽胸痛、體虛外，還有低熱、夜間出汗、顴紅、痰中帶血等癥狀。中醫註重“整體觀”，辨證論治，綜合診治，因此，在治療疾病時，不僅要治療主要癥狀，也要照顧到次要癥狀；不僅要治標，還需要治本，所以需要將不同的藥物配合在壹起使用，起到良好療效。
例如熟地黃和六味地黃丸：熟地黃是治療腎陰虧虛的首選藥物；，六味地黃丸由熟地黃、山茱萸、淮山、澤瀉、丹皮和茯苓六味藥材組成，主要用於治療由於腎陰虧虛、虛火上炎所引起的腎虛病癥。腎虛病人往往服用六味地黃丸，因為單用壹種熟地黃是不可能達到全面治愈疾病目的的，而六味地黃丸能起到更好的治療作用。
藥物特點
每種中藥都有各自的性味和歸經，它們的藥效、作用也不相壹致。有的藥物能補氣，有的藥物能瀉下，有的藥物能理氣，有的藥物能解表，還有的藥物能消食等。即使是同壹類藥物，它們作用的臟腑歸經也是不相同的。如有些能補肝，有些能補腎，有些則肝腎同補。又如黃芩、黃連、黃柏同是清熱瀉火藥，但黃芩味苦性寒清上焦之火，黃連味苦性寒偏於清中焦火，而黃柏味苦性寒卻偏於清下焦火。因此．藥物需配伍使用。
配伍的意義
不同的藥物配合使用，相互之間會產生壹定的作用，有的可以增進原有的療效，有的可以相互抵消或削弱原有的功效，有的可以降低或消除毒副作用，也有的合用可以產生毒副作用。臨床上，藥物配伍使用的目的是增進療效或者降低毒副作用，配伍使用產生毒副作用的藥物臨床多作為配伍禁忌，不宜使用。
增進療效
如麻黃常常配伍桂枝，能增強發汗解表、祛風散寒的作用；知母配伍貝母，可以增強養陰潤肺、化痰止咳的功效；附子、幹姜配合應用，以增強溫陽散寒、回陽救逆的功效；陳皮配半夏以加強燥濕化痰、理氣和胃的功效；全蠍、蜈蚣同用能明顯增強平肝息風、止痙定驚的作用。這類同類藥物配伍應用的例證，歷代文獻有不少記載，它構成了復方用藥的配伍核心，是中藥配伍應用的主要形式之壹。
另外，還有藥物配伍使用是以壹種藥物為主藥，另壹種藥物為輔藥的形式，兩藥合用，輔藥可以提高主藥的功效。如黃芪配茯苓治脾虛水腫，黃芪為健脾益氣、利尿消腫的主藥，茯苓淡滲利濕，可增強黃芪益氣利尿的作用；枸杞子配菊花治目暗昏花，枸杞子為補腎益精、養肝明目的主藥，菊花清肝瀉火，兼能益陰明目，可以增強枸杞子的補虛明目的作用。這類功效不同的藥物配伍，壹主壹輔，相輔相成。輔藥能提高主藥的療效。
降低毒副作用兩種藥物配伍使用，以達到消除其中壹味藥物的毒副作用的效果。如半夏配伍生姜使用，半夏生用有壹定的毒性，可使人咽痛音啞，而生姜可以抑制半夏的毒性作用，用生姜炮制後成姜半夏，半夏的毒性作用就大大降低了；甘遂配伍大棗使用，大棗可抑制甘遂峻下逐水、耗傷正氣的毒副作用；熟地配伍砂仁使用，砂仁可以減輕熟地滋膩礙胃、影響消化的副作用；常山配伍陳皮使用，陳皮可以緩和常山治療瘧疾而引起惡心嘔吐的胃腸反應。這類藥物配伍多用於具有較強毒副作用的藥物，以保證安全用藥，也可用於有毒中藥的炮制及中毒解救。
中藥的毒性和副作用
在很多人眼裏，中藥意味著純天然藥物，無毒副作用，以至於不少病人都習慣選擇服用中藥。難道中藥真的沒有毒副作用嗎?
中藥到底有沒有毒副作用
“龍膽瀉肝丸”可能導致慢性腎臟損害的消息，雙黃連針制劑引起不良反應事件，魚腥草或新魚腥草素鈉的註射劑引起患者過敏性休克、全身過敏和呼吸困難等不良反應等等，壹度鬧得沸沸揚揚，讓“中藥很安全、綠色、沒副作用”的傳統觀念再次受到沖擊。
其實，“中藥沒有毒副作用”是由於不了解中醫中藥而導致的錯誤觀念。早在兩千多年前，《神農本草經》中就記載了藥物的毒性，並依據毒性將藥物分為上、中、下品。現代研究也證明了中藥具有毒副作用，根據國家藥品不良反應監測中心的資料，中藥的不良反應比西藥更多，有的不良反應還非常嚴重，魚腥草註射劑事件以及其他幾種中成藥事件，就是嚴重不良反應的緣故。