2.抑菌作用:黃連對金黃色葡萄球菌、霍亂弧菌和乙型鏈球菌作用較強，對大腸桿菌和傷寒沙門氏菌作用較弱。
3.降血糖:黃連中的小檗堿對血糖的調節與藥物的計量和給藥方式有關。治療糖尿病患者時，可在靜脈滴註中適當加入少量黃連素，可明顯降低生姜的血糖，但需註意黃連素靜脈滴註量不宜過高，以免引起心臟系統的抑制，使心跳減慢。嚴重者可出現橫紋肌溶解和乳酸酸中毒。
4.治療瘧疾:中醫壹直用黃連治療瘧疾等重癥腹瀉。黃連中含有黃連素，也是現代醫學中的非處方止瀉藥。黃連素具有抗菌抑菌作用，對誌賀氏菌、結核桿菌、肺炎球菌、傷寒桿菌、白喉桿菌有抑制作用。對誌賀氏菌作用最強，是治療細菌性腸胃炎、痢疾等消化道疾病的特效藥。
5.消化道炎癥的治療:腸胃炎、胃潰瘍、胃腸炎、腸炎等消化道疾病壹直以來都很難治療。許多藥物對胃腸道有刺激作用。雖然食用後對炎癥有治療作用，但也有刺激和促進作用。很難精確控制藥物的用量。與黃連不同的是，黃連的主要成分黃連素在食用後不會通過胃腸黏膜進入血液，而是由於苦味作用而主要停留在胃腸道內。