2.仔細清理果園，根除病菌源。每年冬天，果農都需要刮去樹木的老樹皮，將枯葉掩埋或焚燒。發芽前用硫磺混合物對全園進行清洗，減少病原菌的初侵染源和害蟲的越冬基地。在生長期，經常去除病葉和病果，人工消滅害蟲，防止有機果樹病蟲害的傳播和蔓延。防止腐爛的方法仍然是傳統技術，即“刮皮、抹泥、包塑紙”的簡單技術。？
3.迷惑法被用來控制害蟲。大多數蘋果園的蘋果樹冠上不時可見紅色、白色或綠色的復合PVC線，這是有害昆蟲的性引誘劑。利用某些鱗翅目害蟲的雌性成蟲在性成熟時釋放的性激素吸引雄性成蟲的機制，通過排列多種性引誘劑釋放的交配信息來減少交配繁殖的機會，從而大大減少害蟲的繁殖。
4、果實套袋。采用套袋栽培技術，可大大減少有機果樹的病蟲害，果實外觀細膩，內在品質明顯提高。
5.充分利用天敵消滅害蟲。有機果園少量使用農藥，配合大量施用有機肥和地面草，為許多有益的鳥類、動物和昆蟲提供了良好的棲息地，從而有效地控制了害蟲的發生。
6.部分果園通過設置防蟲網、使用粘合劑、塗刷白色樹幹等方式，采用了先進的物理光學、電磁防鳥防鼠防獸設置。這些物理防治方法極大地抑制了有機果樹病蟲害的滋生和危害。