孕婦壹般需要口服藥物，哺乳期局部用藥為宜。
當妊娠合並細菌性陰道病時，炎癥可以緩解細菌性陰道病的癥狀和體征，減少細菌性陰道病相關感染的並發癥，降低其他性傳播疾病或人類免疫缺陷病毒(HIV)感染的風險。
細菌性陰道病復發患者可選擇不同於初始治療的抗厭氧菌藥物，或嘗試陰道乳酸桿菌制劑，恢復重建陰道微生態平衡。並根據病情適當延長治療時間。
細菌性陰道病通常不需要治療女性的男性性伴侶，但細菌性陰道病可以在女性性伴侶之間傳播。女性性伴侶要去醫院檢測，可能需要治療。
藥物
醫生會使用藥物治療以下情況:
有癥狀的患者；
妊娠期細菌性陰道病；
需要進行子宮內膜活檢、宮腔鏡、宮內節育器取出、子宮輸卵管造影、刮宮等宮腔手術的患者，術前均發現有細菌性陰道病。
全身用藥
甲硝唑:
它能抑制厭氧菌的生長而不影響乳酸菌的生長，是壹種理想的治療藥物。其不良反應主要是胃腸道反應，如惡心、嘔吐、食欲不振、口中有金屬味、壹過性中性粒細胞減少等。，過敏反應(如皮疹、蕁麻疹和瘙癢)很少。
由於甲硝唑與酒精合用可引起皮膚潮紅、頭暈、嘔吐、腹痛、腹瀉等二硫化物樣反應，患者在治療期間及治療後至少壹天內應避免飲酒。
替硝唑:
不良反應小於甲硝唑，但服藥期間不宜飲酒。
克林黴素:
特別適用於孕婦(尤其是孕早期)以及對甲硝唑不耐受、過敏或治療失敗者。
局部用藥
甲硝唑陰道栓、替硝唑栓
克林黴素軟膏:
在陰道塗抹藥膏，可能會使乳膠避孕套在治療過程中和停藥後至少3天內變得脆弱，從而失去避孕功能。
乳酸桿菌栓劑:
陰道內施用乳酸桿菌可增加陰道的酸度，並通過產生乳酸來抑制加德納菌和厭氧菌的生長。使用後細菌性陰道病復發率低於單用甲硝唑，值得臨床推廣。
外科療法
這種疾病壹般不需要手術治療。
中國傳統療法
沒有循證醫學證據支持中醫治療該病，但壹些中醫治療方法或藥物可以緩解癥狀。建議去正規醫療機構，在醫生指導下治療。