1，醫宗金鏡
公元1739年，清朝乾隆皇帝命吳倩主持編纂壹套大型醫學書籍。吳倩從全國各地搜集了各種新舊醫書，挑選了70多位精通醫術、文科的官員進行編輯。* * *歷時三年，終於編輯好了他們。該書匯集了春秋戰國至明清時期醫書的精華，圖文並茂，圖文並茂，有解有方，有論有曲。“醫宗金鏡”的稱號是乾隆皇帝定的。後來該書被收入《四庫全書》，逐漸成為我國醫學教與學的必讀書目。
2.“我眼中的偉大成就”
黃庭菁(1704 ~？)，於乾隆六年[1741]草成此書，歷經四稿，卻不見付梓。弟子鄧(贊福)得知此書並在嘉慶出版十年。改名為“木刻正宗”。出版九年後，被黃庭靖的孫子看到，於是用家族收藏的舊本修改印刷，很明顯地恢復了原貌。嘉慶二十三年(1818)出版，共23萬余字，居歷次眼科專著之首。
3.醫學起源和發展理論
徐大椿寫於乾隆二十二年(1757)。這本書可以稱為“徐大椿醫學論文集”，有99篇評論文章。第壹冊為經絡、臟腑、脈象、疾病、方藥，第二冊為治療、書論(及各科)、古今。每次有新的想法，都有前人沒說過的，壹般人不敢說的。尤其是批判時代的弊端很多，論據深刻深刻。在中醫史上，缺少這樣壹位慷慨的批評家，而大春是古今第壹人
4.《本草綱目》補遺
十卷，趙學敏於乾隆三十年(1765)初刻，嘉慶八年(1803)增補完成，於趙學敏死後同治三年(1864)初版。後來又多次轉載。
5.張儀彤
是壹部十六卷的綜合性醫學著作，由陸於康熙三十四年(1695)所撰。本書前十二卷論述疾病，包括內科、外科學、婦科、小兒、五官，分門別類，引用古代文獻和歷代醫家的醫學理論。每種病都是先在《內經》和《金匱要略》中論述，後被孫思邈等後人引用。但整體醫學思想與薛基、張介賓相似，對“陽有余，真陰不足”的理論闡述非常有力。從中風到嬰兒，有十六個分支，每個分支都有分子順序。風格取自王肯堂的辨證論治標準，選材更為細致。後四卷論述方劑，共分九十四支，其中壹卷以方祖元委為重點，分析其配伍、作用、治法。另外三冊是專方，按病證分類，有方劑。
6、《古今圖書集成·醫部全錄》
它是康熙年間中國最大的壹種書，由之太子命編《古今圖書總集》十余年而成。康熙帝命其改名為《古今圖書集》，卷數六千余冊，卷數壹萬冊，是百家爭鳴、百家爭鳴的傑作。原書《博物藝典集》下的《醫部考》，共520卷，分類收集了從《內經》到清初的120余種醫學文獻，有經典醫書註釋、各種疾病的診治、醫學藝術、醫家筆記和傳記等。，有描述系統，分類清晰。
7、《外科綜合征治療全生命集》
，又名《外科全壽集》，卷號1，刊於乾隆五年(1740)。吳通過對祖傳秘方和生平經歷的整理，編撰了《外科全傳》。這本書是清末馬培智重新分評的，前後三卷，膾炙人口。王的著作首先從病因、證候、診斷等方面總結了壞疽並發癥的29種。根據人體上、中、下三部論述外科疾病及證候的治療，還包括內科、婦科、兒科疾病的治療經驗。有效外科處方75個，雜病處方48個。此外，還介紹了200多種常用外科藥物的性質和其他制劑，並附有作者的病例，非常方便臨床應用
8、《本草崇源》
三卷，寫於康熙十三年(1674)，是所作，但該書未完成，由弟子高續作。隨後王琦走訪得到壹份，校刊後刻成《醫林指月》系列，已於乾隆三十二年(1767)供後續再版。
本書摘錄了《本草綱目》經典藥物233種(附56種)，是壹種“尊本”的理論。序言說“本書講解藥性，講解五運六氣原理，意為論述藥性理論。藥物分為三類，即藥味、代、陰陽五行、形。
9.“綜合治療和匯款補助”
八卷，清康熙二十六年(1687)出版，李(字秀之，名興安，十七世紀浙江鄞縣人)撰。
本書共分八大類:提綱、內因、外體、上竅、陶隔、腹脅、腰膝、下竅。它不同於以往的書籍，側重於內科雜病。本文介紹了80余種常見的疾病和證候，每壹種疾病和證候都列為壹章，每壹章又分為若幹節。先引《內經》，再選學者，註明書籍。病因、外感、辨證、脈象、治療、用藥、附證、方藥等。都是詳細但不復雜的，也是沒有準備的。被臨床醫生廣泛使用。
10，《本草綱目》
8卷，王昂所寫，康熙三十三年(1694)出版。這本書可以看作是臨床藥物的手冊，也是醫學指南。主要依據《本草綱目》和《神農本草經》。前言是藥性的總義，歸經和炮制要點如下:第壹部191種藥，第二部83種藥，第三部31種藥，第四部40種藥，水木部58種藥，第六部25種藥，第七部魚蟲。先辨別每味藥的氣、味、形、色，然後描述八經、功能、主治，並按藥物所屬的“十劑”記載在藥物的頂端。後期版本增加了400多種藥物圖譜，更加完善。還有很多書刊，廣為流傳。
此外，清代流傳下來的醫學著作也很多，如張誌聰的《蘇文註》和王昂的《蘇文棺槨編註》等，都是醫學名著，對後世醫學的發展起到了非常重要的作用。