壹是由於萌出不完全，後側牙齦覆蓋部分牙冠形成冠周袋，積聚食物和細菌，可引起局部軟組織頻繁發炎，疼痛難忍，甚至導致開口受限，進食困難。有些人不願意在炎癥消失，疼痛停止後拔出炎癥。結果他們又發炎了，癥狀也更嚴重了。
二、大部分智齒向前阻生，即以45度左右的角度支在第二磨牙上，兩牙冠形成夾角嵌入食物。時間長了，第二磨牙就蛀壞了，直到牙髓炎，引起劇烈疼痛。另壹個後果是傾斜的智齒繼續對第二磨牙施力，導致牙周炎和疼痛松動，不得不拔除。
第二磨牙可能需要拔除，咀嚼功能嚴重受損。
第三，有些智齒雖然萌出方向壹般正常，但與第二磨牙的接觸點異常，使食物嵌入，刷牙時不易刷到此處的齒隙，容易導致第二磨牙齲齒，縮短使用壽命。
現在很多人都認為只要不疼就不用治療，不用拔牙。這種觀點是不正確的。因為如果疼了，就說明已經對正常牙齒甚至身體造成了不可逆的傷害。這個時候，智齒造成的損失就很難挽回了。
據統計，50%的人都有智齒，在16歲時陸續萌出。由於這顆牙剛萌出時牙根尚未完全成型，容易被拔除，而此時拔除智齒又避免了對第二磨牙和身體的傷害，所以可以說早期拔除是最佳的治療方案。古人雲:未治先治未病才是真理。
雖然很多人都知道智齒的危害，也知道必須拔掉的原因，但是因為怕疼，不願意去看醫生。其實只要在局麻下把牙完全拔出來，幾乎沒有痛苦，這是很多拔牙者的體驗。所以不用擔心拔牙的痛苦。如果不拔出，疼痛會反復發作。