辣椒也不耐旱。持續高溫和土壤幹旱會使辣椒葉片含水量降低，逐漸枯萎，抗病能力減弱，導致落葉。包括葉斑病和葉枯病。葉斑病是壹種細菌性疾病。發病初期，葉片上出現黃綠色水漬，後期水漬銹跡斑斑，造成大量落葉；葉枯病發生時，會呈現中間帶灰色的褐色小斑點。病斑中心壞死，易穿孔，病葉易脫落。如連續下雨，應及時排水，避免工地長期積水。另外，雨後及時松土，保證辣椒根系生長有足夠的氧氣。增加有機肥的施用量，增加有機質含量，改善土壤通透性。如果天氣幹燥，可以通過合理澆水來改善。
澆水時不要用太多的水，以免土壤過幹或過濕。需要區分葉枯病和葉斑病，並采取相應的防治措施。此外，還可以提前噴灑殺菌劑和葉面肥，提高植物抗病能力，減少病害危害。氣溫高時，要經常澆水以保持土壤濕潤。澆水應該在陽光明媚的早晨進行。最好采用膜下滴灌或地下灌溉，防止棚內濕度過高。如果沒有這種條件，可以經常用少量的水給它澆水。不要大量泡水，以免辣椒長時間泡在水裏。同時澆水後可以避免大雨造成根部積水。暴雨過後，應及時排除場地內的積水；天氣炎熱時，最好用井水灌溉，以降低土壤溫度，保護植物根系。