1.壹般療法
要養成良好的排便習慣，要註意縮短排便時間，排便後立即復位脫垂的直腸，防止水腫和嵌頓。積極治療便秘、咳嗽等引起腹壓增高的疾病，避免加重脫垂和手術治療後復發。可以每天鍛煉肛門括約肌的功能，預防脫垂。
2.膠帶粘貼法
適用於小兒早期直腸脫垂。脫垂的直腸復位後，做直腸指檢，將脫垂的腸管推到括約肌上方，取俯臥位，用紗布卷堵住肛門，然後將臀部並攏，用膠布固定。
3.藥物療法
將硬化劑註入脫垂部位的粘膜下層，或盆腔直腸間隙和直腸後間隙，使粘膜和肌層、直腸及周圍組織產生無菌性炎癥、粘連和固定。常用的硬化劑是5%石炭酸植物油和5%鹽酸奎寧尿素水溶液。對兒童和老人療效還是不錯的，成人容易復發，不適合ⅲ度直腸脫垂患者。
4.外科療法
成人完全性直腸脫垂的手術方法很多，各有優缺點，復發率也不同。有四種手術方法:經腹、經會陰、經腹會陰和骶骨。前兩種方法被廣泛使用。
直腸懸吊固定術在腹部手術治療直腸脫垂中的作用是肯定的。術中遊離直腸後，可將直腸和S型的結腸固定在周圍組織上，主要在骶前側，註意不要損傷周圍神經和骶前靜脈叢。可同時縫合松弛的盆底筋膜和肛提肌，切除多余的S型的結腸和直腸。
經會陰手術安全，但復發率高。脫垂的直腸甚至S型的結腸可以直接從肛門取出並縫合。直腸黏膜脫垂可以通過痔切除術去除。老年人和體質較弱的人可以簡單地進行肛袢收縮術，即在皮下用金屬絲或聚酯帶纏繞肛門，2 ~ 3個月後取出皮下嵌入物，收緊肛門，防止直腸脫垂。
5.腹腔鏡手術
腹腔鏡治療直腸脫垂多采用直腸固定，具有手術損傷小、患者痛苦小、術後恢復快、並發癥少等優點。