本病主要病變在脾胃、大腸、小腸，但與肝腎關系密切。脾虛濕盛是導致本病的重要因素。外因與濕的關系最大，內因與脾虛的關系尤為重要。
(1)感外邪。因邪致瀉以六淫為主，暑濕寒熱之邪較為多見，尤以濕為甚。因為脾喜燥惡濕，感受濕邪，最容易困於脾土，脾失健運，清氣不升，濁氣不降，氣紊亂，傳導失常，水谷不分，混降，導致泄瀉。所以有“濕盛則五瀉”、“無濕則不瀉”之說。此外，寒熱均可侵犯肺衛，由表及裏，損傷脾胃，因升降失調而致瀉，不分清濁，常與濕邪同時發生。
清代金申敖《雜病之源與泄瀉之源》壹文說:“濕盛則泄，單因濕耳。不知風、寒、熱、虛皆可致病，脾強無濕，何樂而不為？雖有風、寒、熱、虛之別，必有異於濕之別。”
(2)飲食不當。食欲過盛，暴飲暴食，停滯不前；或食高亮之厚味，辛辣肥膩，濕熱內生，積胃；或者誤食生冷不潔之物，都導致脾胃受損，運化失職。水谷的精微能量不能被轉移和吸收，而是作為濕停滯停止，導致腹瀉。明代張介賓《凈月全書瀉》中說:“飲食不節，起居頻繁，致脾胃受傷，則水濕，谷滯，精氣不能失，致汙衰瀉。”
(3)肝郁脾虛。當肝失疏泄之功，脾虛弱，或有食滯或濕阻，進而因情誌失調、生氣而氣郁化火，導致肝失疏泄之功，使脾失攻胃，脾胃失和，運化失常，產生泄瀉。如果患者情緒仍然抑郁，又沒有食滯阻濕因素，那麽每次遇到大怒傷或精神刺激，就可能出現腹瀉。正如《凈月全舒瀉》壹文中所說:“凡怒而瀉者，必先怒而食，傷脾胃，故犯之，即隨觸而發。這個肝脾病也是肝木所蓋，肝強脾弱，脾氣受傷。”
(4)脾胃虛弱。長期不吃東西，或者疲勞造成的內傷，或者久病不愈，都可能導致脾胃虛弱。脾氣虛，運化不健，食欲不好，濁濁不交，甚至水轉濕，谷轉郁，濕不去，濁濁不分，就成了泄瀉。
(5)人生之門正在衰竭。脾之陽與腎之真陽關系密切，命門之火可以幫助脾胃分解水谷，幫助脾胃消化吸收。如果年老或久病後腎陽受損，命門之火不足，脾土不能溫煦，運化失常，引起腹瀉。另外，“腎為胃”，腎陽不足，腎陽閉，便排出。如《凈月泉謝舒》壹文指出:“腎為胃之要，受二陰開竅，故二便開合由腎主。腎陰不足，命門就衰。