張仲景主張“精研秘方”，反對“承襲各家之術，傳承到底”，主張以認真、精細的態度從事醫學實踐。這些都是張仲景對醫學做出重要貢獻的學術原則。張仲景被尊為醫聖主要是因為他寫了壹部《傷寒論》。這本書被後人稱為中國第壹部理論、法、方、藥完備的經典著作。根據這本書的原序，張仲景家人口眾多，但沒過幾年，他家三分之二的人都病死了，尤其是那些患傷寒的人。痛苦的現實激起了他寫書治病救人的信念，於是寫下了《傷寒論》卷16。？
《傷寒論》是我國第壹部理論與實踐緊密結合的臨床診療專著，內容十分豐富。在這本書中，張仲景在樸素唯物主義的指導下，總結和發展了祖國病因學理論。當時求巫占蔔之風盛行，統治者崇尚預言迷信，相信鬼神可以主宰人的生死；另壹方面試圖傳播“天人合壹”等神學目的論，用陰陽五行學說解釋疾病的發生。如果說“反木”，疥瘡、熱病就會在民間盛行；事與願違，人們會被血染腫，患眼病...“等等，這會給醫學蒙上壹層神秘主義的色彩。張仲景基於多年的實踐經驗和樸素的唯物主義自然觀，明確指出:“困難很多，但不外乎三種:壹是經絡因內因而被邪氣侵入臟腑；兩者，四肢九竅，氣血運行不通，也在外皮中間；三、房室、金刃、蟲獸。在這個細節上，疾病是疲憊的。”這充分說明，人生病的原因是內臟器官功能的改變，或者是外邪的侵襲，或者是身體因素造成的，與鬼神的命運無關。？