1.選擇中西藥進行內科治療，改變患者胃內環境，使胃石變軟、可溶、變小，改善胃動力功能，促進其自然排出。用碳酸氫鈉治療植物性胃石有很長的歷史。平時口服劑量每次3 ~ 4g，每日3次，7 ~ 10天為1療程。還可以同時服用等量的起泡劑，加強療效，縮短療程。有人主張在上述處理中加入0.5 ~ 1g胃蛋白酶或胰蛋白酶，或將5 ~ 10mg糜蛋白酶(α-糜蛋白酶)溶於50 ~ 100ml水中口服或從胃管註射，或將0.5g乙酰半胱氨酸加入50ml生理鹽水中胃管。對於胃動力差的患者，可使用胃復安(甲氧氯普胺)、多潘立酮或西沙必利，促進胃蠕動，有利於結石排出。此外，據報道，50毫克木瓜蛋白酶或5毫克纖維素酶可溶於1000毫升水中2天。
中醫藥治療胃石病是我國傳統的醫療方法之壹。中醫認為胃石病的病機屬於消化不良，積滯於胃，故常用散結排石湯消積化滯，軟堅散結，補胃健脾，行氣活血。處方中的主藥為厚樸、積食、神曲、麥芽、雞內金、檳榔、三棱、莪術、桃仁、丹參等。，水煎服，每日2-3次，連服5-7天，視證酌情加減。如腹痛患者可加元胡、白芍、甘草；嘔吐患者加半夏、竹茹；大便潛血者加白芨、炒大黃；體虛者加黨參、太子參；便秘增加黃葉或番瀉葉。無論是西藥還是中藥，用藥時間都應在三餐之間或空腹時服用，有利於藥物與胃石充分相互作用，提高治療效果。
2.手法碎石術對於沒有明顯癥狀和並發癥的胃石患者，如柿子石、山楂胃石，可以試行腹部外按摩擠壓，使胃結塊、碎成小塊，然後給予洗胃或瀉藥，加快結塊排出。
3.x線網片碎石法早些年用金屬絲做成網套，插入胃管。鋇劑顯示胃結石時，網套被夾住，收緊鋼絲切開胃結石。反復操作使其切成碎片，自然排出。在此基礎上，還可加入碳酸氫鈉和甲氧氯普胺(胃復安)促進結石排出。
4.纖維鏡在治療胃石癥中的應用發展迅速，有多種匹配方法。在顯微鏡下，可用活檢鉗咬、夾、搗、穿刺胃石的包膜或外殼，然後用水反復沖洗。內窺鏡手術刀也可用於反復切斷包膜和胃石的結塊。或者在纖維內窺鏡下用鋼絲圈套器切開結石體，然後用抓鉗將其抓成碎片，使隨它去吧自然排出。近年來，纖維鏡下激光引爆碎石術已成為國內外治療胃石癥的壹種有效的新方法，尤其適用於較大、較硬的胃石癥。插入纖維鏡看清胃石，用生理鹽水沖洗使其充分暴露。然後註射生理鹽水，使胃石半浸在水中，使其在爆破時有壹定的緩沖力。然後將光纖彈頭通過胃鏡活檢鉗的管道插入，使其緊貼結石中心表面。此時，激光充電引爆，可炸裂或炸開壹個小洞，然後沿裂縫或小洞反復引爆3 ~ 5枚彈頭，可將石塊砸成小塊或顆粒。此外，還有纖維內窺鏡下微波碎石術，這是最近用於治療胃石癥的另壹種簡單方法。常規內鏡下暴露結石，將微波天線通過活檢鉗孔插入，選擇功率60 ~ 90W，將微波電極頭對準胃結石，通電反復燒灼，改變結石位置，直至胃結石呈蜂窩狀或碎塊狀。在纖維內窺鏡下進行上述碎石術時，可通過活檢鉗插入細塑料管，向粉碎的胃石內註入10%碳酸氫鈉150 ~ 200ml，有利於軟化排出胃石，提高治愈率。如果胃石患者沒有並發胃炎和潰瘍，碎石後不需要特殊治療，建議吃少渣飲食3天，1周後復查；如果患者合並胃炎和潰瘍，應給予抗生素、胃粘膜保護劑、組胺和H2受體拮抗劑。
5.體外沖擊波療法(ESWL)已經從治療腎結石發展到治療膽結石。近年來，ESWL已成功用於治療胃結石。治療前兩天給患者餵流質飲食，治療過程中不需要麻醉。病人被要求喝500毫升水填飽肚子。俯臥位B過位後，每分鐘放電80次，電壓12kv，被CDD擊打1500 ~ 2000次，結石普遍破碎。在治療過程中，患者沒有任何不適，也不會造成胃黏膜損傷。3天後b超復查，看胃石是否排盡。
6.手術治療胃結石體積大，質地硬，不易溶解，在內科治療、內鏡碎石、微波或沖擊波治療均失敗，或並發胃潰瘍、出血、穿孔或梗阻的情況下，宜采用手術治療。