檸檬葉可用於提取香料，檸檬鮮果皮可生產檸檬精油，不僅是生產高檔化妝品的重要原料，也是生產治療結石病藥物的重要成分。果胚還能產生果膠——橙皮苷(Vp)。果膠不僅是生產高檔糖果、蜜餞和果醬的重要原料，還可用於生產治療胃病的藥物。橙皮苷(VP)主要用於治療心血管疾病。從果胚中提取的果汁可用於生產高級飲料和高級果酒。果渣可用作飼料或肥料；種子可從高級食用油中提取或入藥。所以檸檬全身都是寶，是加工綠色產品的重要原料。
檸檬的醫療作用在古代醫書中早有記載。明代藥師李時珍所著《本草綱目》中記載，檸檬有生津止渴、祛暑的作用。檸檬汁味苦，性溫，無毒。《陸川本草》說，檸檬果、果皮汁有散結、健胃、止痛、治滯腹痛之功效，不思飲食。現代醫學認為，檸檬是預防心血管疾病的藥食同源。因為檸檬酸在人體內與鈣離子結合形成可溶性復合物，可以緩解鈣離子，促進血液凝固。因此，高血壓、心肌梗死患者常喝檸檬水，對改善癥狀大有裨益。