1，功效不同:辣椒的主要功效是利尿消腫、祛痰平喘；花椒具有溫中止痛、殺蟲止癢的功效。
2、異病治療:花椒可以輔助治療水脹、哮喘、盜汗等疾病；花椒可用於中寒腹痛、寒濕嘔吐腹瀉的輔助治療，也可用於蟲積腹痛、濕疹、瘙癢等。