治療主要針對病因。有結核或梅毒者應進行抗結核或抗梅治療。抗生素、激素和維生素B12可用於肌肉註射或滴眼藥水。如果是絲狀角膜炎，角膜表面的絲會在幾天後脫落，但紅外線輻射會加速脫落，或者用鑷子取出。
由於角膜炎的病因大多不明，很難徹底治療。疾病發展起來，會很難治愈，容易復發，要盡早治療。
炎癥消除後，殘余的角膜混濁可用熱敷和紅外線照射治療。如果吸收無望，視力也受到影響，隱形眼鏡有時會部分恢復視力。如果視力恢復不理想，可以進行角膜移植。
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