1.藥物治療:可常規使用維生素，如維生素B1、維生素B12，也可使用改善線粒體功能的藥物，如艾地苯醌或血管擴張藥，如尼麥角林。目前壹些藥物，如抗焦慮藥，如丁螺環酮，也能在壹定程度上緩解和改善共濟失調的癥狀。此外，丙戊酸鈉等抗癲癇藥物已被動物實驗或臨床試驗證明可改善小腦萎縮引起的臨床表現。
2.康復治療:如經顱磁刺激也可改善臨床。
目前功能性治療或幹細胞移植仍處於臨床試驗階段，是否有效還需要未來更多的醫療機構或實驗室進行研究，以證明藥物的臨床療效。因此，對於小腦萎縮，目前通過藥物治療或康復治療來緩解臨床癥狀，但不能完全治愈。