1.疫苗免疫
免疫接種可采用強毒疫苗和弱毒疫苗兩種疫苗。肉雞可在孵化後第3、8、16天混合或飲用，種雞和蛋雞可在第3、60、60天選擇混合或飲用。註意，疫苗免疫只能用於早期預防球蟲病，不能用於緊急免疫。
2.環境衛生
患球蟲病的病雞要及時隔離，保證雞舍環境幹燥衛生。因為球蟲的抵抗力很強，除了用熱水或堿水消毒外，還要盡量控制雞舍內濕度21%-33%，溫度18-40的環境，球蟲在1-5天內即可死亡。經常更換墊料，避免因長時間不更換墊料而引起的雞球蟲病。保證飼料和飲用水清潔，雞舍通風良好，雞群密度適宜。
3.藥物管制
使用球蟲特效藥百球力康，預防雞小腸球蟲和盲腸球蟲的發生，防止全組感染，控制病雞血便，減少傷亡；改善雞的飼料樣、胡蘿蔔樣、血樣糞便，治療小腸和盲腸腫大、出血和充血；提高飼料轉化率，減少浪費，降低成本。