(2)補充處理，即“缺什麽補什麽”，應補應儲。當維生素B12缺乏時，肌肉註射維生素B12，每天100μg，持續2周，然後每周兩次，持續***4周，或直到血紅蛋白恢復正常，是前6周的治療，維生素B12的總量應在2000μg以上..以後維持劑量改為每月100μg，或每年2-4月1mg，但維持劑量要每月壹次，這樣患者復發的機會就少了。
有神經系統癥狀的患者，維生素B12的劑量應略高，每2周進行壹次維持治療。神經系統癥狀持續1年以上，很難恢復。所有惡性貧血、胃切除、先天性內在因子缺乏的患者都需要終身維持治療。維生素B12缺乏禁止單用葉酸治療，因為會加重對神經系統的損害。
葉酸缺乏可口服葉酸治療，每日3次，每次5毫克。腸吸收不良的人也可肌註四氫葉酸鈣3 ~ 6mg/天，直至糾正貧血和病因。如果不清楚患者缺乏哪種營養素，維生素B12也可以和葉酸結合使用。有人認為，兩種藥物聯合應用治療營養性巨幼細胞性貧血患者，效果優於單用葉酸。
經過1周的補充治療，網織紅細胞上升到峰值，白細胞和血小板在2周內恢復正常，貧血在4 ~ 6周左右糾正。