醫院眼科是江蘇省中醫臨床重點專科和示範專科建設單位，省中西醫結合眼科研究中心，常州市醫學重點學科建設單位，常州市眼科診療中心。是江蘇省中西醫結合學會眼科專業委員會所在地。開展常見疑難眼病的診斷和治療，包括白內障超聲乳化及人工晶狀體植入術、青光眼內外引流術、玻璃體切除術、各種斜視手術、眼部整形手術、屈光配鏡等。眼病、斜視、整形等專科門診7個，約占全市眼科醫生總數的70%。65438-0996在常州率先開展準分子激光近視手術，技術成熟，經驗豐富，設備領先。服務範圍覆蓋省內及山東、浙江、安徽、江西等周邊地區。
醫院耳鼻喉科於2005年被批準為省級中醫臨床重點專科。在開展耳鼻咽喉科各種常見病、多發病診療的同時，開設了聽力康復、過敏性鼻炎、嗓音疾病等專科門診。喉顯微外科在這方面具有傳統優勢，鼻內鏡手術及相關技術發展迅速。